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4 d-proteomics™

随着timsTOF平台的引入,技术的下一个发展是通过使用TIMS结合UHR-QTOF技术,增加了一个额外的气相离子分离维度。这使得3d蛋白质组学(保留时间,m/z和MS/MS指纹)转变为4d蛋白质组学™(增加了固有的CCS值)。

4 d-mbr dia-PASEF

4D-MBR和dia-PASEF®:引领4d -蛋白质组学™领域

在timsTOF Pro和timsTOF fleX中添加离子迁移维度带来了比提高灵敏度、选择性和MS/MS采集速度更多的好处。独特的tims设计允许重复测量所有检测到的离子的碰撞截面(CCS)值,这些可以进一步提高系统的选择性,从复杂的样品和短梯度分析中提供更多可靠的相对定量信息。

4D-MBR:解决值缺失的问题

4D-MBR:解决短梯度LFQ实验缺值问题

DIA是解决价值缺失问题最常用的收购策略。然而,使用它需要建立光谱库——当涉及到不常见的生物时,这可能是及时和困难的——而传统的培养基方法太慢,无法与短梯度分析兼容。在这种情况下,PASEF-LFQ提供了速度、灵活性和可靠性。然而,即使使用> 100Hz的MS/MS,在每次分析中也可能不会选择一些肽片段,特别是在使用短梯度时。

已经开发了运行间匹配(MBR)方法来解决这个缺失值的问题。MBR提取所有要量化的肽的强度信息,使用狭窄的m/z和保留时间窗口。这种过滤器的组合,以前认为不够具体,导致不准确的比率测量。4D-MBR增加了额外的CCS过滤器的第一个m/z和保留时间,允许更大的特异性,如我们的应用说明所示151年质

4D-MBR应用于高通量血浆蛋白组学结果,用于192例患者和20份QC血浆样品的定量,使用Evosep One LC系统以11.5 min梯度分离。(点击放大)

dia-PASEF

DIA - pasef®:将DIA分析提升到一个新的水平

DIA的组合与PASEF®允许弥补传统DIA陷阱:通过使用的m / z隔离模式窗口内连续蒂姆斯事件、离子的比例用于dia-PASEF®可以大大增加(达到100%低复杂度样本,还有5 x高于传统DIA方法使用可比隔离窗大小和m: z范围高复杂性的样品)。必威官网体育下载dia-PASEF®循环时间可以减少,使其与短梯度分离兼容,同时保持高选择性。它受益于tims空间浓度效应,允许增加灵敏度,并将DIA选择性提高到下一个水平,完全4d -蛋白质组学™支持。

dia-PASEF®数据现在可以使用OpenSwath & MOBI-DIK或Biognosys的Spectronaut软件进行处理。通过阅读我们的申请笔记了解更多157年质160年质