代谢物参考数据库
BBIOREFCODE 2是一个数据库,目前包含800种化合物的光谱,这些化合物通常作为体液中的代谢物或作为食品、饲料和饮料样品中的成分。此外,还包含各种典型的污染物。
AMIX软件提供强大的搜索算法来识别数据库中的化合物混合物光谱。这允许从筛选应用中分配意想不到的信号和组分的识别。
光谱以不同的pH值提供,使得混合光谱和数据库的实验条件可以匹配数据库搜索。
在定义良好的条件下,在600MHz下获得核磁共振数据。质子谱提供了11个不同的pH值从pH 3到pH 8。主要pH 3,5和7的二维光谱(JRES, COSY, TOCSY, HSQC和HMBC)以及pH 3和7的13C光谱。所有化合物都提供了三维结构,并完全指定了光谱。数据生成是一个持续进行的过程。一旦安装了数据库,就可以使用新的可用化合物包对其进行升级和扩展。
2018年6月,所有ph值数据库BBIOREFCODE 2发布了50种新化合物的包。目前,该数据库共包含800种化合物。
高数据质量
数据库中提供的所有光谱都是在确定的条件下,在600 MHz的水溶液中获得的。以IVDr为例,按照标准操作规程进行操作。数据提供了多达11个不同的pH值,这使得混合物光谱的实验条件精确匹配。
所有光谱被清理(可在历史文件中审核,其中列出了每个工作步骤)并完全分配。它们存储在一种特殊的压缩格式,大大减少了数据量,并允许极其快速的搜索过程以及同时处理大量光谱。
数据库和使用
目前BBIOREFCODE的完整数据库包括800个组件。它包括一个基本包350个,一个主要升级包150个和目前5-6个小升级包50个化合物。套餐可以单独购买。在任何时候都可以使用进一步的包进行升级。
对于数据库的使用,AMIX是必需的,但不包括在包中。可以使用现有的AMIX安装。
可用的包
BBIOREFCODE2 pH7的pH7光谱仅用于体液应用。完整的数据库现在有700种化合物。
新
用于化合物751 - 800的升级包6可用于现有BBIOREFCODE2作为SHD011(A)-06。
包含数据
通常,在pH3-8的步骤为pH 0.5的步骤中,提供10个不同pH值的数据。PH 3,5和7的2D数据,包括舒适,Tocsy,JRES,HSQC和HMBC。某些化合物的溶解度和或稳定性可以将数据的采集限制为某种pH范围或防止供应2D和13C数据。
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