老鼠和人类有着共同的祖先，因此它们的基因和基因组非常相似也就不足为奇了。由于这种相似性，小鼠被用作研究人类生物学的模型生物。在老鼠的帮助下，疾病，如癌症，心血管疾病或大脑疾病，都可以研究。
MR显微镜可以获取大脑中神经元通路的活体图像(图2和图3)，甚至可以记录跳动的心脏的视频(图3)，其中每个视频序列的单个图像都可以被EKG触发，以获得更好的图像分辨率。额外的标记物质可以在图4中突出炎症等区域。
小鼠脑的高分辨率梯度回波实验。: 3D FLASH， (15 × 15 × 25)µm3，线圈为MICWB40 RES 700 1H/13C, TR/TE 100/11 ms, AV=2，翻转=60°，BW 89285 Hz，第1 PE方向部分傅里叶1.37，总扫描时间= 15h 14min
四个心室和主动脉的可视化。IntraGateFLASH, TR: 10 ms, TE: 1.8 ms，分辨率:(78 × 59 × 800)µm³，扫描时间:8 min
扩散加权磁共振，16.4 T垂直内径，15 mm线性线圈，TR/TE 400/22.8 ms;分辨率0.1×0.1×0.1 mm, b=5000 s/mm2， δ/Δ=2.5/14 ms，总成像时间32 h。
MSME 1H参考图像(FOV 40 x 40 mm2, 0.16 x 0.16 x 1 mm3)旁边是RARE全氟碳标记的19F图像(FOV 40 x 40 mm2, 0.31 x 0.31 x 1 mm3)和组合图像。图像通过30mm 1H/19F Birdcage谐振器获得。全氟碳标记的巨噬细胞和单核细胞旅行到炎症的地方，导致这些细胞的局部聚集。这些累积可以通过19F磁共振成像显示出来。
MSME 1H参考图像(FOV 40 x 40 mm2, 0.16 x 0.16 x 1 mm3)旁边是RARE全氟碳标记的19F图像(FOV 40 x 40 mm2, 0.31 x 0.31 x 1 mm3)和组合图像。图像通过30mm 1H/19F Birdcage谐振器获得。全氟碳标记的巨噬细胞和单核细胞旅行到炎症的地方，导致这些细胞的局部聚集。这些累积可以通过19F磁共振成像显示出来。
MSME 1H参考图像(FOV 40 x 40 mm2, 0.16 x 0.16 x 1 mm3)旁边是RARE全氟碳标记的19F图像(FOV 40 x 40 mm2, 0.31 x 0.31 x 1 mm3)和组合图像。图像通过30mm 1H/19F Birdcage谐振器获得。全氟碳标记的巨噬细胞和单核细胞旅行到炎症的地方，导致这些细胞的局部聚集。这些累积可以通过19F磁共振成像显示出来。
引用:
应用说明:小鼠心血管磁共振，Ulrich Flögel，海因里希海涅大学实验心血管成像，Düsseldorf，德国floegel@uni-duesseldorf.de，
https://www.google.com/url?sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web&cd=&cad=rja&uact=8&ved=2ahUKEwiu0OX2mNbpAhXnUBUIHQarClUQFjABegQIAxAB&url=https%3A%2F%2Fwww.fatactor.com%2Ffileadmin%2Fuser_upload%2F8-PDF-Docs%2FPreclinicalImaging%2FT177101_App_Note_Cardiovascular_Magnetic_Resonance_in_Mice.pdf&usg=AOvVaw3wGL-QsA312ORCKC9Ho5qp(更好的链接需要)
Ianuş，安德拉达等。“准确估计小鼠大脑中微观扩散各向异性及其时间依赖性。”神经影像183(2018):934-949。
mordrich, Randal X.等。比较小鼠脑束扩散磁共振成像神经影像51.3(2010):1027-1036。