分析细胞结构及其组织对于理解任何细胞类型中的功能至关重要。然而,由于光学衍射极限〜200-300 nm,传统的光学显微镜不可能可视化许多亚细胞结构。
单分子定位显微镜(SMLM) - 使用高级显微镜技术进行的有效,直接的过程 - 解决这个问题,使研究人员能够能够探索与细胞功能相关的结构,组织,相互作用和化学计量学方面的新细胞生物学领域。
许多有趣的细胞结构小于〜200-300 nm的光学衍射极限。这些包括大多数细胞器和所有大分子机器,通道和受体的子结构。
询问和回答有关这些结构和其他结构的分子组织,相互作用和化学计量的问题,需要在低于光的衍射极限的分辨率下对标记结构进行成像。
常规的光学显微镜方法,例如广场和共聚焦显微镜,可以图像和识别特异性标记的细胞结构。但是,它们的图像能力低于光学衍射极限。或者,电子显微镜(EM)可以横向下降至0.1-0.2 nm,但是细胞内分子的特定标记或定量测量非常具有挑战性。
Super-resolution microscopy supports high-resolution imaging—down to 20 nm laterally and 50 nm along the optical axis —of specifically labeled cellular structures. It thereby bridges the gap between conventional light and electron microscopy (EM) techniques.
*Right: Mitochondria stained for TOM20 with Alexa 647, imaged with SMLM (dSTORM).
高分辨率(横向20 nm)与图像特异性标记结构的能力配对,使SMLM成为细胞生物学研究中的强大解决方案。用SMLM制成的发现包括Hela细胞中染色质结构域的局部运动,Xenopus卵母细胞的核孔复合物中的八倍对称性以及Centirar蛋白CEP164的径向对称性以及内型视网膜内部肾小管结构内的径向尼诺对称性。[[1,2]。
Super-resolution microscopy supports high-resolution imaging—down to 20 nm laterally and 50 nm along the optical axis —of specifically labeled cellular structures. It thereby bridges the gap between conventional light and electron microscopy (EM) techniques.
在确定SMLM是否是正确的解决方案时,必须考虑可视化感兴趣结构所需的分辨率。提供了一些适合用SMLM成像的衍射限制结构大小的示例。示例*包括(但不限于):
*纳米级子结构及其尺寸的示例来自“有用的生物学数据库”。关联:https://bionumbers.hms.harvard.edu/search.aspx
Specifically,当研究问题需要时,SMLM是研究细胞内特定纳米级结构的最佳方法:
SMLM已经被用来回答以前未开发的细胞生物学问题。SMLM是在3D和高分辨率和量化数据中成像多个特定结构的理想选择。请参阅下面的示例数据和描述,以了解有关SMLM可以唯一实现的研究应用程序的更多信息:
With the top-hat illumination feature of Bruker's Vutara VXL, the whole field of view is illuminated evenly, resulting in uniform and reliable data acquisition across the entire region of interest. Not only does SMLM acquire a uniform image, but each localization data point contains statistical information that can be used for quantitative analysis. With this technology, absolute quantification of molecules is possible. Relative quantification is also possible.
例如,间隙连接蛋白Connexin43和电压门控钠通道NAV1.5)均位于嵌入式磁盘中。但是,SMLM透露CX43和NAV1.5并未以相等的数量表达,也不形成相似数量的簇[3]。
分析整个领域照明也很关键molecular distribution within a sample. The ability to illuminate the entire field of view, as well as the acquisition of statistical information associated with each localization, supports unbiased and quantitative analysis of the distribution of molecules throughout a sample. As an example of molecular distribution analysis, SMLM allowed for the visualization of the distribution of the ParA ATPase with the ParB DNA binding protein localized to the cell poles, for the coordination of chromosome segregation and cell division[1]。
SMLM解决了无法在200 nm之内成像分子的问题。使用SMLM,可以以〜20 nm或更少的分辨率进行图像,从而支持在彼此之间共定位的分子的准确成像。例如,使用SMLM,发现虽然Connexin43和Nav1.5之间存在密切的关联,但不到20%的connexin43簇,只有10%的NAV1.5簇直接与彼此重叠,并且它们确实重叠,但它们的位置,,它们在哪里重叠,但这是最小的 - 表明簇切向切碎而不是代表两种蛋白质的完全共定位的种群[3]。
使用SMLM,可以通过高空间分辨率实时成像细胞内分子的运动。带有SMLM细菌细胞中单粒子跟踪的成功示例表明,肌动蛋白同源物MREB在细胞壁合成的驱动[4]。
右:两个实验监测线粒体动力学,标记为(1)橙色Halotag®染料(549)和(2)可光活化的远红色染料(PA-JF-646®)。
使用原始/seconday抗体标记的Alexa 647标记的固定微管的VXL -DSTROM图像中获得的微管。
在用Alexa 647转铁蛋白标记的活BSC1细胞的VXL成像上获得。
Point-Cloud Representation of Sodium Channels and N-cadherin Molecules
图像提供:
Rengasayee Veeraraghavan博士和Heather L. Struckman,B.S。,M.S。在俄亥俄州立大学纳米心脏病学实验室
Bruker的Vutara VXL提供了一流的易用性和成像深度。支持细胞生物学研究人员需求的关键特征包括:
Bruker的Vutara VXL非常适合细胞生物学研究需求,需要(1)高分辨率,(2)3D可视化和/或(3)分子特异性靶向,适用于从单个细胞到组织样品到组织样品的样品50微米厚。
简化了Vutara VXL,微流体和SRX软件的工作流程和使用,Bruker科学家可以提供个性化的支持,从样本准备到数据分析到vutara vxl用户。
SMLM通过高精度定位单个闪烁的染料分子来实现超分辨率。衍射限制的光学显微镜无法区分小于300的距离内的两个染料分子,因为它们的点传播功能重叠过多。在SMLM中,两个染料分子中只有一个是活性的,而另一个染料分子是黑暗的。现在,我们可以以高精度来确定该分子的位置。一段时间后,活性染料变黑,先前的黑暗染料变得活跃。现在,我们可以以高精度来确定第二分子的位置。染料的开关开关可以积极发生(例如,棕榈中的可传动荧光蛋白)或自发(例如,dstorm中的Alexa Fluor 647)。
可以使用SMLM成像各种样本类型。固定样品和实时样品都可以用SMLM成像,尽管固定样本成像更常见。使用Vutara VXL,可以对各种样本类型进行想象,从细胞培养和组织切片,整个生物,例如果蝇幼虫和秀丽隐杆线, and hydrogels up to 100 microns thick.
借助Vutara VXL的双平面技术,可以从水凝胶中的盖玻片中最多图像100微米,以及高达50微米的厚样品,例如组织切片甚至整个生物体。厚的组织或整个生物样品可能需要清除组织才能进行最佳成像。
尽管SMLM是一种新的高级成像方法,但示例制剂和成像协议得到了充分的理解和记录。Bruker应用程序专家可以帮助用户选择适当的标签策略和成像设置。
Although less common than fixed-sample imaging, live-sample imaging can be performed with SMLM. View this webinar discussing the preparation of live samples for imaging. See "References and Resources" for more information on live-cell imaging techniques and best practices[3,4]。