核磁共振的软件

基于片段筛选

基于碎片的筛选(FBS)工具在TopSpin提供了一种软件,用于获取、分析和报告筛选数据

Bruker的基于碎片的筛选(FBS)工具在TopSpin提供了一种软件,用于获取、分析和报告筛选数据

片段筛选是基于片段的铅发现(Fragment Based lead discovery, FBLD)中广泛应用的铅分子发现方法。在uM到mM范围内较弱的结合亲和性是碎片的特征,需要适当的配体筛选方法来检测结合配体,特别是那些结合常数低的配体。

目前有许多生物物理方法用于碎片筛选,其中核磁共振是最常用的方法,其次是表面等离子体共振(Surface Plasmon Resonance, SPR)。核磁共振是检测这些配体的理想方法,通过核磁共振的筛选可以控制筛选库的质量,这使得核磁共振优于其他方法,如SPR或热位移。

基于碎片的筛选(FBS)工具通过简化整个采集分析流程,利用核磁共振数据的力量。所有相关数据、实验类型、化合物id、参考光谱等信息自动收集,存储在项目文件中,显示屏显示相关数据供分析。

技术细节

新的工具大大简化了基于核磁共振的碎片筛选。

  • 在允许多个用户分析数据集的xml文件中跟踪用户操作
  • 以microsoftexcel格式报告结果
  • Topspin内部的实现允许同时进行处理和分析。项目的当前状态被实时保存在项目文件中,并且每次在定义的项目文件夹中启动筛选工具时都会重新加载
  • 支持的NMR数据:1D 1H抑制水光谱,1D 19F光谱,自动识别光谱类型:饱和转移差分,waterLOGSY, T2和T1rho

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