用PaSER运行并完成

帕瑟2022

PaSER 2022是一个GPU驱动的实时数据库搜索平台,为自下而上的蛋白质组学提供并行计算能力和实时数据库搜索结果。

立竿见影!

实时结果=效率

帕瑟

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PaSER是效率和节约

实时结果通知您当前仪器和样品状态

分析时间
数据库搜索需要时间,一旦采集完成,就用不妥协的搜索结果消除这一步骤。
仪器时间
确保每一分钟都很重要,有了PaSER,你可以确信你的乐器时间是以最有意义的方式度过的。
珍贵样品
保存这些珍贵的样本!无论是单细胞、临床、SILAC还是浓缩的PaSER smarts都将确保它们不会被不必要地浪费。
成本
仪器时间、试剂和样品制备成本高昂。PaSER和Run&Done将节省资金,因为您可以确信您正在生成有意义的数据。

卡拉克提克

帕瑟2022

4D蛋白质组学™ 具有实时搜索结果和智能采集功能

整合PaSER提供的实时数据库搜索和智能采集,突破数据分析瓶颈

普遍可用

  • 所有当前和未来的timsTOF Pro和fleX平台都可以通过PaSER访问

4D蛋白质组学™

  • CCS感知的数据非常丰富,即使如此,实时数据库搜索功能在PASR中也是现实的,包括PTM(如磷酸化)功能

用GPU实现大规模并行化

  • PaSER是GPU驱动的,可跨数千个CUDA内核提供强大的计算能力

PaSER数据回顾

  • 从高级实验信息到感兴趣的特定碎片离子光谱,通过所有PaSER盒上的集成查看器,自信地查看数据的复杂细节
聪明
  • PaSER是智能的,在样本采集结束时,用户定义的蛋白质或肽鉴定决定了样本队列的进程,这将检查适用性,节省宝贵的样本、昂贵的耗材和仪器时间

Avantages

帕瑟2022

从时间和成本节约中获益

  • 不用再担心注射那些珍贵的样本了。
  • 不再担心浪费仪器时间。
  • 不必再担心那些试剂和样品制备昂贵的样品,只需在性能较差的系统上注射。
  • 不再等待QC运行以确定系统适用性。
  • 方法开发期间不再等待搜索结果。

应用

帕瑟2022

在不到5毫秒的时间内完成全面的数据库搜索

搜索速度极快,搜索结果毫不妥协。

A) 使用PaSER对人类细胞裂解物进行重复DDA运行以获得实时结果的蛋白质ID,并以MaxQuant为基准

B) 使用PaSER对人类细胞裂解物进行重复DDA运行以获得实时结果的肽ID,并以MaxQuant为基准

C) PaSER和MaxQuant鉴定了97%的相同蛋白质和近90%的相同肽。

PaSER提供从实时搜索中获得的一致结果,与离线搜索相同数据的结果相同。由于数据库搜索算法在GPU上运行,与基于CPU的搜索相比,搜索时间可以忽略不计。

除了实时搜索之外,为特定应用(包括PTM研究)搜索更大空间的机会也成为现实。

看看你一直缺少什么

由TIMS Viz支持的MOMA查看器提供了前所未有的查看4D蛋白质组数据的强大能力。四极矩和TOF上游的迁移率分离和聚焦导致等压和近等压物种的分离。使用其他技术,在PTM富集和复杂样品分析的情况下,共洗脱物种通常是等压或接近等压的质量co碎片。timsTOF Pro/fleX首先通过碰撞截面分离离子,从而避免了这种情况。对此类事件进行可视化、搜索和排序的能力以前从未出现过。我们将等压质量称为具有不同迁移率值的迁移率偏移质量对齐(MOMA),TIMS Viz可以在复杂运行中梳理出此类事件。TIMS Viz允许您自行设置公差,同时覆盖数据库搜索后观察到的特征和PSM。TIMS Viz使您能够查看以前不知道的内容。必威官网体育下载

韦比奈尔斯

视频

Témoignages

“我们的timsTOF Pro上的PaSER box提供的实时结果大大节省了时间。这使我们能够实时开发方法,了解LC和仪器性能,并总体上提高效率。”

Sebastian Vaca博士,美国剑桥麻省理工学院和哈佛大学广泛研究所(Carr实验室)蛋白质组学平台研究科学家

“创新的软件工具是解决质谱学无法回答的生物学问题的必要工具。timsTOF Pro的捕获离子迁移功能和健壮性提供了独特的自下而上蛋白质组学功能,可有效用于研究许多疾病。”

约翰·耶茨三世教授,加州拉霍拉斯克里普斯研究所的欧内斯特·W·哈恩教授

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