4D中的常规
TIM增加了分离的第四维度
基于质谱(MS)的蛋白质组学已成为一种强大的技术,用于鉴定和量化成千上万的蛋白质。然而,由于电流质谱仪的速度,灵敏度和分辨率有限,完全蛋白质体的覆盖率仍然非常具有挑战性。
timsTOF Pro使用了并行累积序列碎片(PASEF®)获取方法,提供了极高的速度和灵敏度,以达到新的深度的散枪蛋白质组学和磷蛋白质组学,使用低样本量。
捕获的离子迁移率光谱法(TIM)首先是气相中的分离技术,其除了HPLC和质谱外,还可以消解除了分离的额外尺寸的样本复杂度,增加了复合物表征的峰值容量和置信度。同样重要的是,TIMS装置还用于累积和浓缩给定质量和移动性的离子,使得灵敏度和速度的独特增加以及分离的附加尺寸。
在霰弹枪蛋白质组学中实现接近100%的占空比
对于高灵敏度的近100%占空比,现在可以通过双刻度技术实现高速霰弹枪蛋白质组学。新颖的设计允许离子在前部中累积,而后部中的离子在离子迁移率上依次释放。此过程称为并行累积串行碎片或pasef®。
第二代双TIMS分析仪针对霰弹枪蛋白质组学的需求进行了优化。由于其独特的几何离子,从TIMS分析仪的第二部分释放到它们的迁移率,而进一步的进入离子可以在TIMS分析仪的第一部分中并行累积。利用平行累积技术实现近100%的占空比,导致几乎没有离子损失。
在timsTOF Pro中,采用了先进的分段四极质量滤波器,以提高离子的传输和隔离效率。四极质量位置与特定离子从TIMS分析仪的洗脱时间同步。由于其超高质量位置切换时间(< 1毫秒),它使PASEF具有最佳性能®方法。
考虑到速度,布鲁克的专家重新设计了MS/MS技术,以满足shotgun蛋白质组学的要求。肽离子采用捕获离子迁移谱法分离,洗脱(~ 100 ms), QTOF检测,生成TIMS ms热图。在PASEF®方法使用相同的时间分离与四极其在洗脱期间隔离一定的离子物质,并立即移至下一个前体。父母和片段光谱通过移动值对齐。通过平行累积序列碎片(Pasef®)技术> 100 Hz测序速度可以实现。与pasef.®方法通过选择几次,可以增加低丰富肽的MS / MS光谱质量。
pasef.®:适合霰弹枪蛋白质组学
timsTOF Pro由PASEF提供动力®提供排序速度> 100 Hz而不会失去灵敏度或分辨率。这是通过将四极性隔离质量窗窗同步与来自TIMS漏斗的特定肽包装的洗脱时间来实现的。
唯一PASEF®启用质谱仪
Bruker在2016年推出了2016年作为革命性的离子移动性技术的时间(被困离子移动光谱)技术,在极紧凑的装置中实现了前所未有的离子迁移率水平。第二代双重时间分析仪现在启用Passf®(并行累积串行碎片),用于为霰弹枪蛋白质组学进行新的无与伦比的速度,灵敏度和分辨率的新标准。
坚固耐用,无需清洗
用于霰弹枪蛋白质组学的许多MS仪器需要每两周一次或每月清洁在大型样本队列时24小时运行,并且在较短的时间段内明显明显劣化。TIMSTOF PRO的卓越稳健性意味着仪器可以在多天或数周内运行24/7,而不会明显损失灵敏度或其他性能指标。
TIMSTOF Pro允许在超过100Hz的测序速度下分析数百个具有最小样品负载(<200ng)的样本。所有这些都具有不妥协的蛋白质组学深度。这改变了蛋白质组学完成的方式,但它也释放了一个新的约束数据分析。现代研究人员必须使用TimStof Pro处理数百个信息密集内容。对于大多数流水线而言,这在数据分析步骤中创建了一个瓶颈。Bruker正在通过引入称为PASER(实时并行数据库搜索引擎)的实时数据库搜索功能来创新此步骤,其删除数据分析障碍。一旦LC-MS运行完成,使用Paser,结果就在手中或运行并完成。
MaxQuant/Perseus和PEAKS Studio数据处理
开放文件数据格式允许研究人员直接使用原始数据和行业领先的软件。MaxQuant已被用于管理空间中的4维(4D)特征,包括保留时间、离子迁移率、
质量和信号强度,有利于多肽、蛋白质和翻译后修饰的鉴定和定量。PEAKS Studio将从头测序与传统的数据库搜索相结合,并对timsTOF原始数据的处理进行了优化。
prm-PASEF®:实现高通量、高灵敏度的靶向蛋白质组学
实现高通量、高灵敏度的靶向蛋白质组学。的prm-PASEF®为了充分发挥并行累积序列碎片(PASEF)的优势,提出了一种新的采集方法®)收购策略对目标蛋白质组学领域。
原代分泌胰岛素胰腺β细胞的蛋白质组学研究
在TIMSTOF PRO上对翘曲速度MS / MS采集的集成离子迁移率的组合为β-细胞生理学和潜在的糖尿病潜在的新靶向途径铺平了道路。
高吞吐量4D-PROTEOMICS™ - 应用DIA-PASEF的应用®和短升级的推翻一个
TIMSTOF Pro提供两种独特的技术的组合,即由被捕获的离子迁移光谱(TIM)提供的第四维度,以增强离子分离和灵敏度和平行累积串行碎片(Pasef®的)
提高离子利用率和数据采集速度。
“我们现在知道,当从两个维度(保留时间和m/z)分析肽混合物时,它们仍然非常复杂。原则上,再增加一个维度会让我们取得很大进展。除了额外的分离维度,timsTOF Pro使我们以极高的速度和灵敏度深入蛋白质组,使用更少的样品材料。”
仅供研究用途。不用于临床诊断程序。