新闻发布详情

• 布鲁克帕瑟™ 现在，该软件结合了具有变革性CCS功能的DIA-NN深度神经网络学习和突破性的DIA PASEF能力，以识别：
  • >8000 40分钟梯度定量细胞裂解蛋白
  • >5000定量细胞裂解蛋白在evossep One上4.8分钟分离
  • >5000定量蛋白仅在10 ng细胞裂解液消化95分钟梯度
• timsTOF Pro上正在进行的CCS“prm Live”支持低成本、有针对性的蛋白质组学，其中含有1800个以上的肽，具有最高的灵敏度和良好的CVs
• ccs支持的TIMScore™算法的进展产生了显著更大的肽和蛋白质覆盖，肽鉴定更有信心
• Novel OligoQuest™软件和工作流程，用于高可信度序列验证，支持RNA和改良寡核苷酸疗法的开发
• SCiLS™自动驾驶软件，用于在timsTOF fleX和rapifleX MALDI平台上使用Bruker IntelliSlides™进行自动质谱成像(MSI)采集
• 展示了两个已经在2021年6月推出的新系统:
  • timsTOF SCP用于无偏单细胞蛋白质组学(SCP)，例如，在空间癌症生物学中研究细胞类型特异性蛋白质组，并将它们与sc-RNA-seq转录组关联
  • 新一代timsTOF专业2以前所未有的蛋白质组学深度和吞吐量

费城--（商业通讯）--在69^th在费城，力量公司(纳斯达克:BRKR)宣布了新型ccs支持的4D蛋白质组学，用于主要功能的增强timsTOF Pro 2，timsTOF fleX和timsTOF SCP质谱仪。

本新闻稿以多媒体为特色。浏览全文:https://www.businesswire.com/betway捕鱼游戏下载news/home/20211102005437/en/

Bruker生命科学质谱副总裁Rohan Thakur博士解释道：TIMScore由斯克里普斯的耶茨实验室开发的，通过对正向和诱骗/反向肽的实验CCS进行预测，减少了肽候选含糊不清。CCS值的应用在我们与Charité的Ralser实验室的合作中增强了DIA-NN，在我们与乌得勒支大学的Scheltema实验室的合作中也增强了PhoX™交联肽的检测。最后，Dana Farber癌症研究所的Marto实验室刚刚发布了ccs人口、难民和移民事务局生活实时保留时间校正，用于平行靶向、高灵敏度、低CV定量超过1800个肽。”

一个。不是由已启用的CCS供电DIA-NN对于dia PASEF工作流

翻译蛋白质组需要高通量、短梯度和不受影响的蛋白质组深度，使用dia-PASEF实现自然方法[Mann, Nat Meth 2020]，并由各种蛋白质组学软件包支持，包括DIA-NN, Spectronaut, MaxQuant和PEAKS Online。DIA-NN软件[Demichev, Nat Methods. 2020] 1.8版包含了一个新颖的CCS模块，用于深度神经网络学习在dia-PASEF中评分肽谱匹配[Demichev, bioRxiv 2021]。

Bruker与柏林查里特大学的Vadim Demichev博士和Markus Ralser博士合作，目前正在将支持CCS的DIA-NN集成到timsTOF平台的PaSER GPU驱动的蛋白质组学软件中，以增强识别和定量。Ralser教授及其同事的工作加速了洛杉矶的翻译蛋白质组学rge样本队列，通过使用dia PASEF在5分钟的采集时间内识别超过5000个定量蛋白质而具有转化性。

Charité的爱因斯坦生物化学教授Markus Ralser博士评论道:“我们对timsTOF Pro在我们实验室的表现印象非常深刻。我们也很高兴看到Bruker将Vadim Demichev的DIA-NN的开源版本纳入其PaSER实时蛋白质组学工作流程，并期待与Bruker合作，进一步改善4d蛋白质组学工作流程。”

B。prm-PASEF生活增加了用于高灵敏度定量的靶向肽的数量

与传统的PRM方法相比，PRM - pasef的目标化合物获取并行化工作流程保持了很高的敏感性，同时目标化合物也更多。现在可以独立使用新的prm- pasef编辑器，或者在使用Skyline™创建prm方法时使用。最近的一篇论文教授杰罗德·Marto et al。“PRM-LIVE困离子迁移谱法及其应用在激酶抑制剂的选择性分析“动态调整保留时间窗口为可再生的目标调度使用红外热成像肽作为保留时间标准量化60 1857胰蛋白酶的肽细胞溶解产物分钟的收购。这种创新prm-PASEF生活这一概念克服了色谱在保留时间上的漂移，提高了多目标的定量精度和重现性。马托博士将出席11月2日布鲁克新闻发布会^nd美国东部时间上午11点。

C。TIMScore对于支持CCS的数据库搜索引擎

4d蛋白质组学应用中的CCS值用于无标记定量的“运行之间的匹配”后处理[Cox, MCP 2020]。TIMScore现在利用机器学习的ccs算法，使搜索引擎提供更大的肽和蛋白质识别，同时保持严格的错误发现率(FDR)。利用数十万个实验数据点，训练出一种能够准确预测胰蛋白酶肽和磷酸化肽CCS值的ML算法。磷酸化在细胞信号和生物学中起着至关重要的作用，但磷酸化的多肽更难识别。在Dana Farber癌症研究所Eric Fischer教授提供的未富集白血病细胞系样本中，TIMScore使磷酸化肽的数量增加了>10%。

南佛罗里达大学的Stanley Stevens教授补充道:“TIMScore使小鼠小胶质细胞磷酸化肽的鉴定增加了11%。CCS值和4d蛋白质组学在质谱蛋白质组学的应用中已成为不可缺少的部分。TIMScore有望改变DDA搜索的执行方式，识别更多有意义的肽和蛋白质，允许我们使用CCS深入蛋白质组。”

d .的OligoQuest™

Bruker的GLP ready中的新OligoQuest软件生物制药罗盘套件提供增强的RNA和寡核苷酸特性。寡头任务利用高同位素保真度模拟人生2和timsTOF职业以表征核酸大分子，如单导RNA及其杂质。此外，快速PASEF获取图谱来自消化mRNA样本的复杂混合物。

与RiboDynamics, LLC合作开发的寡头任务提供算法和工作流注释串联质谱数据从寡核苷酸序列>100核苷酸。RiboDynamics的首席执行官Dan Fabris和康涅狄格大学的Harold S. Schwenk Sr.教授解释说:“同位素保真度结合超高分辨率质谱分析显示了高度修饰的RNA的巨大前景，但是还没有商业软件工具。使用OligoQuest简化这种分析，将极大地加快RNA领域的研究和开发。”

E。SCiLS自动驾驶仪用于自动MALDI质谱成像(MSI)

Bruker介绍了MALDI成像的自动设置SCiLS™自动驾驶仪通过IntelliSlides™。SCiLS自动驾驶仪自动执行六个关键的性能优化，以快速从准备好的幻灯片移动到数据的获取。扫描后的样本图像在IntelliSlide上的条形码上注册，自动检测组织边缘，然后自动进行多步优化，以减少MALDI成像所需的时间和专业知识，并确保再现性和图像质量。通过SCiLS自动驾驶仪自动化，MALDI成像可以很容易地被非专业用户集成，为他们的4D-Omics研究添加生理组织背景。

MALDI Imaging的Bruker主任Michael Easterling博士说：“随着MALDI成像技术在生物制药领域的市场应用，智能自动化对于确保成像的无缝集成和稳健结果的驱动非常重要。采集和处理软件与成像优化平台（如timsTOF fleX）的深度平台集成为多组学提供了空间生理背景。”

参考资料：

[Mann, Nat Methods 2020]:https://doi.org/10.1038/s41592-020-00998-0
[Demichev, Nat Methods. 2020]:https://dx.doi.org/10.1038%2Fs41592-019-0638-x
[Demichev bioRxiv 2021]:https://doi.org/10.1101/2021.03.08.434385
(考克斯,MCP 2020):https://doi.org/10.1074/mcp.tir119.001720
[,肛交。化学2021):https://doi.org/10.1021/acs.analchem.1c02349

关于力量的公司(纳斯达克:电流断路器)

布鲁克使科学家能够取得突破性的发现，并开发新的应用程序，提高人类生活质量。Bruker的高性能科学仪器和高价值的分析和诊断解决方案使科学家能够在分子、细胞和微观水平探索生命和材料。必威手机客户端通过与客户的密切合作，布鲁克在生命科学、分子和细胞生物学研究、应用和制药应用、显微镜和纳米分析以及工业应用方面实现创新、提高生产力和客户成功。必威东盟体育Bruker在临床前成像、临床表型研究、蛋白质组学和多组学、空间和单细胞生物学、功能结构和凝析生物学以及临床微生物学和分子诊断领域提供差异化、高价值的生命科学和诊断系统和解决方案。请访问www.fatactor.com．

查看源版本businesswire.com：https://www.businesswire.com/betway捕鱼游戏下载news/home/20211102005437/en/

媒体接触
佩特拉雅伯
布鲁克道尔顿营销传播公司
电话：+49（421）2205-2843
艾凡:petra.scheffer@bruker.com

投资者关系联系
T: +1 (978) 663-3660, ext. 1479
艾凡:Investor.Relations@bruker.com

来源:力量公司