- 新的VIP-HESI离子源将分析流程4D-Metabolomics、4D-Lipidomics和小分子定量筛选工作流程的灵敏度提高了10倍以上
- 介绍新的用于timsTOF平台的METLIN-4D大型4D-Metabolomics CCS库
- 集成机器学习的CCS-Predict Pro软件的未知代谢物
- MetaboScape和TASQ 2022软件中支持ccs的新的4D工作流程，包括减少假阳性识别的4D- lipidomics工具
BILLERICA,质量。——(BUSINESS WIRE)——在Bruker的虚拟4d代谢组学™eXceed研讨会(eXceed symposium 4D-Metabolomics 2021 | Bruker)，力量Corporati近日，该公司宣布推出一种新的VIP-HESI来源，以大幅提高敏感性，并推出新的集成软件工具，以提高对4D-Metabolomics和4D-Lipidomics工作流程的信心。
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timsTOF Pro 2与VIP-HESI来源(图片:Business Wire)
的激烈VIP-HESI离子源使灵敏度提高高达16倍的有效脱溶剂，使新的应用在所有小分子应用。VIP-HESI源可以被接口到新的timsTOF专业2平台提高4d代谢组学和4d脂质组学的敏感性。它还具有高性能的兼容性影响二世QTOF系统用于提高食品、环境、法医和制药应用中农药、药物和药物代谢物的定量分析，提高灵敏度，允许检测低水平污染物。
布鲁克的合作者通过测量碰撞横截面(CCS)在4d代谢组学方面取得了重大进展。的METLIN-4D库利用TIMS/PASEF方法提供准确的CCS值。Scripps的Gary Siuzdak教授在现有的METLIN库中扩展了基础设施，生成了世界上最大的> 50万种化合物的MS/MS谱库。加入METLIN-4D后，在atimsTOF职业系统将与MS/MS库一起提供，增加了额外的信心水平。这允许在timsTOF社区中使用CCS值，通过减少歧义来增加信心——从而减少假阳性注释。
力量还介绍了CCS-Predict职业，一种优化的算法，用于预测小分子结构的CCS值。CCS-Predict职业为未知化合物提供大规模的ccs生物信息学支持。CCS-Predict职业使用机器学习进行正确识别，在小分子工作流程中缩小可能的结构，包括暴露体学和药物代谢物分析。
所有4D小分子工作流程可在更新MetaboScape 2022继续革新ccs工作流程的软件。4d -脂质组学的进一步进展包括在MetaboScape 2022为脂质组学提供易用性。潜在的假阳性鉴定使用了一种新的显示方式，其中CCS值和保留时间决定了基于MS/MS碎片结果的鉴定是否符合脂质结构。这种正交脂质特性的使用可以提高结果的准确性，并更快地验证潜在的脂质生物标志物。
布鲁克还宣布将CCS的价值纳入TASQ 2022通过其定量TargetScreener工作流程，提供更准确的食品和环境样品中的污染物识别。所有这些工具的结合使4d -脂质组学和4d -代谢组学易于采用，在生物学和分子水平上提供更完整的见解。
答:VIP-HESI
真空绝缘探头-加热ESI源是一个集成APCI探头的双源。VIP-HESI源与timsTOF系统兼容，适用于低µL/min到mL/min的LC流速。在正离子和负离子模式下，HESI和APCI模式都显示了显著的灵敏度增益。例如，在头发分析中，滥用药物的灵敏度增益平均为x16，这允许创建一个更详细的药物使用时间轴，因为可以提取更小的头发样本长度。
在环境和食品分析中，增益超过x10的另一个应用已经被证实，这种改进可以简化样品制备，或使出现的低水平污染物(如PFAS型分子)的早期检测成为可能。在timsTOF系统上使用VIP-HESI也允许在相似的保留时间洗脱异构体，并由其CCS分离，从而单独定量。这种强大的结合使研究人员在暴露体中更详细地阐明影响人类暴露体的化合物。最后，在负离子模式下，血浆中的脂质获得了x5的增益。这导致使用4D-Lipidomics鉴定出更多具有生物学意义的独特脂质。
b .最大蒂姆斯CCS图书馆METLIN-4D发射
CCS值的测量是小分子集成4D工作流程最可靠的方法。METLIN-4D CCS库是首个测量超过10,000个参比化合物的CCS库，可以大大提高小分子研究的鉴定和化合物确认。所有标准化合物的CCS值均在atimsTOF平台有积极和消极两种模式。内容可以与布鲁克链接MetaoBASE个人库3.0，其中包含了来自METLIN化合物库的10万个化合物的MS/MS谱图，增加了化合物注释的可信度MetaboScape 2022．
加里·西乌兹达克(Gary Siuzdak)是加州拉霍亚斯克里普斯研究中心代谢组学和质谱中心的教授和主任，他说:“CCS值为分子添加了一个正交标识符。在timsTOF平台上，所有分析物的CCS值都是“免费”获取的。我们可以使用这些CCS值，通过使用新的METLIN-4D库，在广泛的化合物中增加注释的信心。我们将继续增加已经获得的10,000个CCS值，并继续扩大这个库。”
C。CCS-Predict Pro和MetaboScape 2022
MetaboScape 2022是Brukers all-in-one软件解决方案的最新版本，用于支持ccs的代谢组学和脂质组学，并实施了最新的脂质标记建议。4D Kendrick质量缺陷分析与基于动态交叉验证的回归模型的自动离群值检测进行了补充。由无库的基于规则的标注工具标注的脂类，将根据使用3D超平面模型计算的预测CCS值自动进行评级。Bruker代谢组学和脂质组学业务部门经理Lucy Woods博士评论道:“我们的4d -脂质组工作流程利用CCS预测和Kendrick质量缺陷分析，减少了脂质注释的不确定性。这些功能让任何实验室都能轻松采用4d -脂质组学。”
对于其他小分子结构，CCS-Predict职业预测CCS值以帮助注释并减少可能的候选值。
先驱之一在CCS预测使用机器学习,朱教授郑江,代谢组学研究中心主任在上海有机化学研究所(SIOC)指出:“随着CCS预测,最后有可能充分利用CCS注释中的值未知的化合物。这给非靶向代谢组学和脂质组学研究带来了翻天覆地的变化”。
朱正江教授现在正在使用timsTOF职业继续为机器学习方法构建训练集的平台。他继续说道:“timsTOF Pro是一个非常多功能的平台;您可以在一个平台上执行所有应用程序。该仪器的设计超过了市场上任何其他产品。”
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