4 d-proteomics™

随着timsTOF平台的引入,通过使用与UHR-QTOF技术耦合的TIMS,增加了气相离子分离的额外维度,从而实现了技术的下一个发展。这导致了3d -蛋白质组学(保留时间、m/z和MS/MS指纹图谱)向4d -蛋白质组学™(增加了固有的CCS值)的转变。

4 d-mbr dia-PASEF

4D-MBR和dia-PASEF®:引领4d -蛋白质组学™领域

timsTOF Pro和timsTOF fleX中添加离子迁移率维度带来的好处比灵敏度、选择性和质谱/质谱采集速度的提高更多。独特的tims设计可重复测量所有检测到的离子的碰撞截面(CCS)值,这些值可用于进一步提高系统的选择性,从复杂的样品和短梯度分析中获得越来越可靠的相对定量信息。

4D-MBR:解决缺失值问题

4D-MBR:解决短梯度LFQ实验缺值问题

DIA是解决价值缺失问题最广泛使用的收购策略。然而,使用它需要建立光谱库——当涉及不常见的生物体时,这可能是及时和困难的——传统的DIA方法太慢,无法与短梯度分析兼容。在这种情况下,PASEF-LFQ提供了速度、灵活性和可靠性。尽管如此,即使使用> 100Hz的MS/MS,一些肽可能在每次分析中都不能被选择片段,特别是在使用短梯度时。

已经开发了运行间匹配(MBR)方法来解决这个缺失值问题。MBR使用狭窄的m/z和保留时间窗口提取所有肽的强度信息。这种滤波器的组合,以前认为不够具体,导致不准确的比率测量。4D-MBR为第一个m/z和保留时间添加了额外的CCS过滤器,允许更大的特异性,如我们在应用说明中所示151年质

结果用于192例患者和20个QC血浆样品的定量,使用Evosep One LC系统以11.5分钟的梯度分离。(点击放大)

dia-PASEF

DIA - pasef®:让DIA分析更上一层楼

DIA与PASEF®的结合可以弥补传统DIA的缺陷:通过使用模式中的m / z隔离窗连续蒂姆斯事件、离子的比例用于dia-PASEF®可以大大增加(达到100%低复杂度样本,还有5 x高于必威官网体育下载传统DIA方法使用可比隔离窗大小和m: z范围高复杂性的样品)。dia-PASEF®循环时间可以减少,使其兼容较短的梯度分离,同时保持高选择性。它受益于tims空间浓度效应,允许提高灵敏度,并将DIA选择性提高到一个新的水平,与完整的4d -蛋白质组学™支持。

dia-PASEF®数据现在可以使用OpenSwath & MOBI-DIK或Biognosys的Spectronaut软件进行处理。请阅读我们的申请须知了解更多信息157年质160年质