蛋白定量
量化更多的蛋白质
开发以满足样本限制和吞吐量的要求
准确的蛋白质相对定量是定量蛋白质组学的基础之一。这对于正确理解生物组装或生物标志物面板发现实验是至关重要的。布鲁克的蛋白质组学解决方案提供了速度、选择性、灵敏度和健壮性的独特组合，允许用户在有限数量和/或短梯度时间内获得更多蛋白质的可靠定量信息。
PASEF®lfq和4D-Match之间的运行(MBR):从两个世界得到最好的
非目标蛋白定量的典型挑战是周期时间(确定色谱峰分辨率)、确定肽量所选择离子的唯一性(选择性)和系统灵敏度(低丰度化合物的定量)。基于质谱的方法提供了全面的定量结果，但重叠离子降低了这些工作流程的选择性。MS/MS (DIA)为基础的定量提供了优良的选择性，但降低了灵敏度。
TIMS-PASEF®基于无标记定量（PASEF）®-LFQ）结合了这两种方法的优点。TIMS提供了额外的分离维度，大大提高了选择性，而TIMS细胞的预浓缩效应提供了更高的灵敏度。PASEF®与传统的DDA方法相比，其速度(>100 Hz MS/MS)大大提高了亲本离子选择的重现性。
在这种情况下，timsTOF Pro独特的4D-MBR方法可以以前所未有的灵敏度克服缺失值问题。
进入第四维度
在某些情况下，高度复杂的样品或短梯度分析，100hz MS/MS填充率不足以在大量的分析中重复选择相同的离子
在这种情况下，可重复的碰撞截面测定(流动性)使4D-Match Between Runs (MBR)最大限度地从Label Free定量实验中定量蛋白质的数量，同时保持高通量样品分析的最高置信水平。最新的PEAKS和MaxQuant版本支持4D-MBR方法。阅读我们的相应的LC-MS154申请须知．
走向未来：引入dia PASEF®
数据独立采集(DIA)， DIA - pasef®利用分子质量和流动性之间的相关性来锁定最密集的肽区域。额外的维度增加了选择性，增加了灵敏度和更短的周期时间。获取更多关于dia-PASEF的信息®推动4d -蛋白质组学™的极限，阅读我们的LC-MS157应用注释．
先进的蛋白质组学处理软件
最大数量数据处理
MaxQuant是一款流行的、功能强大的开源软件，完全支持PASEF®-LFQ数据支持高级定量、可视化和报告。
高级软件支持
越来越多的高级蛋白质组学处理软件包现在直接读取timsTOF PRO原始数据：包括Skyline、基因数据、完整的蛋白质度量套件、吉祥物蒸馏器
峰值数据处理
PEAKS Studio从tims数据文件中高性能提取特征，在基于肽的蛋白质鉴定、无标签定量和DeNovo测序中获得高质量的结果。多种复杂的可视化和导出功能允许用户查看、共享或优化多个蛋白质组分析的结果。
为高通量临床研究做好准备
timsTOF Pro在数千次注射中提供可持续性能的独特能力，结合增强的LFQ性能，使该系统成为高通量临床研究的理想平台。
数据处理是蛋白质定量和PASEF测定的关键®一些最强大的软件套件已经支持lfq方法。
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文学的房间
仅供研究使用。不用于临床诊断程序。