Proteoforms

自底向上的散弹枪蛋白质组学是非常敏感的,允许研究者深入挖掘蛋白质组。然而重要的生物学信息如选择性剪接或内源性蛋白质水解的影响仍然是一个重大的挑战。

分析完整Proteoforms

通过分析完整的蛋白质形态来解锁另一个维度

直接分析未消化的蛋白质形式可以克服许多限制,并构成一个非常强大的工具,生物标志物候选发现。Bruker的uhr - qtof具有处理非常复杂的完整蛋白质混合物的能力,没有分辨率损失、准确性或动态范围,使它们特别适合这项任务。

为临床研究提供自上而下的发现
自上而下蛋白质组学中完整蛋白质的复杂混合物对许多质谱仪来说是一个重大挑战。在质谱分析之前使用广泛的预分馏在某种程度上克服了这一问题。尽管预分馏有效,但在比较大样本队列时,会导致重复性问题。Bruker的UHR-QTOF系统从复杂的蛋白质形态混合物中提供高重现性和准确的信息,并且需要较少的样品预分离,从而提高了重现性,并使其与临床研究所需的大样本队列相兼容。

从显示定量结果的蛋白质分析研究生成的标签自由火山图。

处理完整的蛋白质混合物

Bruker的UHR-QTOF系统结合了全灵敏度分辨率和真同位素模式(TIP™),用于复杂混合物中完整蛋白质的精确测量。强大的解剖™和SNAP™算法提取准确的质量和强度信息,用于完整蛋白质的直接标签自由分析。所有布鲁克QTOF仪器都提供四极杆

CID片段谱非常适合于识别低到中等分子量的蛋白质形态,而maXis II的额外ETD片段功能甚至可以从大型蛋白质形态中生成丰富的序列信息。

蛋白质形态分析解决方案

Bruker的蛋白质形态分析解决方案包括自动化整个过程的方法,从校准、提取和输出测量完整的蛋白质特征,通过统计分析识别调控的蛋白质形态。然后,这些信息可以用来创建一个预定的前体片段列表,使相应的蛋白质形态能够有效的片段化,从而进行识别。

经20分钟梯度分离的脑脊液提取液的解剖™处理可恢复超过120个洗脱峰,对应超过800个不同的蛋白质形态。
5.2分钟后解卷积完整的蛋白质光谱。利用SNAP™计算单同位素质量,将实验确定的非常精确的同位素模式(真同位素模式)考虑在内。