timsTOF Pro由PASEF提供动力

timsTOF职业

采用PASEF®技术的timsTOF Pro在扫描速度方面提供了革命性的改进,增强了特异性和高灵敏度

4D中的经济学

TIMS增加了分离的第四维度

timsTOF_Pro-web_人像

母亲是żniejsze informacje

蒂姆斯托夫

加速四维组学

速度
采用并行累积串行碎片(PASEF)技术可实现> 100hz的测序速度。
高吞吐量
极高的数据采集速度大大提高了生物实验的吞吐量。
深度
由于PASEF的灵敏度提高,可以识别更多的肽及其翻译后修饰(PTM)。
健壮性
独特的仪器设计与正交反射进入TIMS,可以在不清洗仪器的情况下对数千个样品进行常规操作。

Cechy charakterystyczne

timsTOF Pro由PASEF提供动力

4D蛋白质组学的新标准™ - 更快更深入地研究蛋白质组

基于质谱(MS)的蛋白质组学已成为鉴定和定量数千种蛋白质的强大技术。然而,由于当前质谱仪的速度、灵敏度和分辨率有限,完整蛋白质组的覆盖范围仍然非常具有挑战性。

timsTOF Pro使用了并行累积序列碎片(PASEF®)获取方法,提供了极高的速度和灵敏度,以达到新的深度的散枪蛋白质组学和磷蛋白质组学,使用低样本量。

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双重蒂姆

捕获离子迁移率光谱法(TIMS)首先是一种气相分离技术,除了HPLC和质谱法之外,它通过增加分离维度来解决样品的复杂性,增加峰容量和化合物表征的可信度。同样重要的是,TIMS装置还可用于积累和浓缩给定质量和迁移率的离子,从而实现灵敏度和速度的独特提高以及额外的分离尺寸。

鸟枪蛋白质组学实现接近100%的占空比
双TIMS技术现在可以实现高灵敏度、高速鸟枪蛋白质组学的近100%占空比。这种新颖的设计允许离子在前部累积,而后部的离子则根据其离子迁移率依次释放。这个过程称为并行累积串行分段,或PASEF®.

并行累积-串行片段化(PASEF®)。timsTOF Pro仪器中的PASEF®策略,其中离子累积,而第二个TIMS区域连续洗脱肽物种。
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卓越的硬件性能

第二代双TIMS分析仪针对鸟枪蛋白质组学需求进行了优化。由于其独特的几何结构,离子的释放取决于它们从TIMS分析仪第二部分的迁移率,而更多的进入离子可以在TIMS分析仪的第一部分中平行累积。采用并行累积技术,占空比接近100%,几乎没有离子损失。

在timsTOF Pro中,采用了先进的分段四极质量滤波器,以提高离子的传输和隔离效率。四极质量位置与特定离子从TIMS分析仪的洗脱时间同步。由于其超高质量位置切换时间(< 1毫秒),它使PASEF具有最佳性能®方法。

timsTOF Pro的示意图
timsTOF Pro由PASEF提供动力

帕塞夫®

并行累积-串行碎片化(PASEF®)循环时间:通过使四极杆与TIMS洗脱时间同步,在100毫秒的时间范围内,平均可以碎片化12个前体。智能软件将低水平前体多次用于PASEF®ms/ms碎片化。

考虑到速度,布鲁克的专家重新设计了MS/MS技术,以满足shotgun蛋白质组学的要求。肽离子采用捕获离子迁移谱法分离,洗脱(~ 100 ms), QTOF检测,生成TIMS ms热图。在PASEF®方法使用相同的TIMS分离,四极在洗脱过程中分离特定离子物种,并立即转移到下一前体。父谱和片段谱通过迁移率值对齐。使用并行累积串行分段(PASEF®)可实现技术>100 Hz的定序速度。用PASEF®方法对低丰度多肽进行多次筛选,提高其质谱质量。

帕塞夫®:非常适合鸟枪蛋白质组学
timsTOF Pro由PASEF提供动力®提供大于100 Hz的测序速度,而不会失去灵敏度或分辨率。这是通过使四极隔离质量窗口与TIMS漏斗中特定肽包的洗脱时间同步来实现的。

科兹奇

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坚固耐用,无需清洗

唯一PASEF®启用质谱仪
Bruker于2016年推出了TIMS(俘获离子迁移谱)技术,作为一项革命性的离子迁移技术,在极其紧凑的设备中实现了前所未有的离子迁移率分辨率。第二代双TIMS分析仪现在支持PASEF®(并行积累-串行片段化)为鸟枪蛋白质组学的速度、灵敏度和分辨率设定了新的标准。

坚固耐用,无需清洗
许多用于鸟枪蛋白质组学的MS仪器在大样本队列上每天24小时运行时,需要每两周或每月清洗一次,并且在更短的时间段内性能会明显下降。timsTOF Pro卓越的鲁棒性意味着该仪器可以在数天或数周内全天候运行,而不会出现明显的灵敏度损失或其他性能指标。

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PaSER运行和完成-动态不妥协的数据处理

timsTOF Pro允许在测序速度超过100 Hz时,以最小样本负载(<200 ng)分析数百个样本。所有这些都与不妥协的蛋白质组学深度有关。这改变了蛋白质组学的工作方式,但也释放了一个新的约束——数据分析。现代研究人员必须使用timsTOF Pro处理数百个信息密集的内容样本。对于大多数管道,这会在数据分析步骤中造成瓶颈。Bruker通过引入称为PaSER(实时并行数据库搜索引擎)的实时数据库搜索功能创新了这一步骤,从而消除了数据分析的障碍。使用PaSER,一旦LC-MS运行完成,结果就在手或运行并完成。

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深入到第四维度

MaxQuant/Perseus和PEAKS Studio数据处理
开放文件数据格式允许研究人员直接使用原始数据和行业领先的软件。MaxQuant已被用于管理空间中的4维(4D)特征,包括保留时间、离子迁移率、

质量和信号强度,有利于多肽、蛋白质和翻译后修饰的鉴定和定量。PEAKS Studio将从头测序与传统的数据库搜索相结合,并对timsTOF原始数据的处理进行了优化。

Aplikacje

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重新定义蛋白质组学的吞吐量和敏感性

短梯度(30分钟、60分钟和90分钟)的深度蛋白质组覆盖,使用100 ng的HeLa消化液
转化为高蛋白质组覆盖率的速度和灵敏度
俘获离子迁移谱(TIMS)和平行积累-串联碎裂(PASEF)的联合功率®)允许更大的蛋白质组或亚蛋白质组(例如磷酸蛋白质组)覆盖率,而无需蛋白质组学中经常使用的大量样品(通常为1-4µg的肽混合物)。
从少于200 ng的样品负载中可以获得优异的结果,因此降低了样品制备成本和MS维护频率。使用90 min的梯度长度,可以从典型的人类细胞系裂解液中识别出5400多个蛋白质组。timsTOF Pro还可以从较小的样品中提供可重复的定量信息高度复杂混合物的数量。

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最新timsTOF Pro应用说明

prm-PASEF®:实现高通量、高灵敏度的靶向蛋白质组学
实现高通量、高灵敏度的靶向蛋白质组学。的prm-PASEF®为了充分发挥并行累积序列碎片(PASEF)的优势,提出了一种新的采集方法®)目标蛋白质组学领域的获取策略。

原代分泌胰岛素胰腺β细胞的蛋白质组学研究
timsTOF Pro上集成离子迁移率与warp speed MS/MS采集的结合为深入、分子水平理解β细胞生理学和潜在的糖尿病新靶向途径铺平了道路。

高通量4D蛋白质组学™ – dia-PASEF的应用®而Evosep则适用于短梯度
timsTOF Pro提供了两种独特技术的组合,即捕获离子迁移谱(TIMS)提供的第四维,以增强离子分离和灵敏度以及并行累积-串行碎片(PASEF)®)
提高离子利用率和数据采集速度。

网络研讨会

Referencje

“我们现在知道,当从两个维度(保留时间和m/z)分析肽混合物时,它们仍然非常复杂。原则上,再增加一个维度会让我们取得很大进展。除了额外的分离维度,timsTOF Pro使我们以极高的速度和灵敏度深入蛋白质组,使用更少的样品材料。”

Matthias Mann教授,德国马克斯·普朗克生物化学研究所蛋白质组学和信号转导系主任

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