SRX软件
使用SRX软件进行定量分析
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分析
生物成像是一种定量学科
虽然图像本身可以在视觉上令人印象深刻并提供定性的描述性信息，但生物成像却更多地集中在定量测量上。定量测量使科学家可以检验和检查假设并进行数据驱动的实验。
定位显微镜在一段时间内生成一组精确的分子位置数据。然后将这些数据用于创建图像。本地化数据允许对样品中的分子位置进行直接定量分析，从而提供了与基于图像的技术（例如STED和SIM）的根本不同类型的分析。
SRX软件中可用的测量类型
SRX软件提供了许多工具，可允许用户根据获得的本地化数据的统计分析执行测量。测量包括空间分布，聚类分析，共定位，分辨率分析，实时细胞分析和用于建模的控制数据的生成。
空间分布
研究定位数据的空间分布的实验是基本分析，并且可以成为其他分析水平的前体。空间分布测量提供了有关细胞不同区域内定位密度的宝贵信息。比较细胞区域之间的定位分布差异或跨处理或条件的同一细胞区域中的差异可以提供对分子组成的有用见解，并提供对理解途径和分子功能有价值的推论。提供用于分析分布的工具包括Ripley的K，配对相关性和最近的邻居。
聚类分析
分子通常形成簇，可以通过空间分布分析轻松辨别出簇。基于其他光学显微镜模态（例如共聚焦）的发现，通常在实验前假定或假设簇的潜在存在。
簇中存在的分子的重要性可能与它们的结构作用，功能作用或两者有关。在某些情况下可能会形成簇，这与细胞中的条件变化有关。簇也可能在不同条件下改变组成。簇的形成和组成也可能与其他簇或分子有关（参见共定位）。
聚类分析提供了对样品中观察到的簇的更详细的分析。“集群分析”对话框允许用户设置用于群集分析的参数，例如粒子类型，群集大小和粒子计数，并具有显示功能以帮助可视化群集的形成，并具有多种测量参数，以查看和输出到.csv或.csv或.csv或.mat文件。聚类可视化也可以显示在主SRX可视化窗口中，可用于过滤数据。
聚类分析测量包括粒子计数，簇面积，簇密度，簇大小（体积），质心位置和PCA分析。
共定位
共定位是聚类分析和空间分析的自然扩展，并允许用户检查不同类型分子的簇以及不形成簇的分子的关系。
“集群分析”对话框允许用户为不同群集类型的分子配置测量。输出显示共定位测量，表格数据以及在SRX可视化窗口中显示图像的图形显示。共定位数据可以以.CSV和.DAT格式输出。
共定位测量包括Mander的重叠系数，强度相关商，配对相关，最近的邻居，关节直方图和Storm-RLA群集分析。
活细胞分析
实验实验通常需要随着时间的推移量化粒子或簇（对象）的位置变化。实时细胞分析跟踪粒子位移并显示其随着时间的流动。
然后可以从该数据中生成距离，速度和角分布直方图，以协助分析。图形显示和移动图可以作为图像输出，并且表格数据可以作为.csv和.mat文件输出。
