4D蛋白质组学™

timsTOF Pro和timsTOF fleX中离子迁移率维度的增加比灵敏度、选择性和MS/MS采集速度的提高带来了更多的好处。独特的tims设计允许重复测量所有检测离子的碰撞截面（CCS）值，这些值可用于进一步提高系统的选择性，从而从复杂样品和短梯度分析中获得越来越可靠的相对定量信息。

DIA是解决价值缺失问题最广泛使用的收购策略。然而，使用它需要构建光谱库——当它涉及一种罕见的生物体时，这可能是及时而困难的——而传统的DIA方法速度太慢，无法与短梯度分析兼容。在这种情况下，PASEF-LFQ提供了速度、灵活性和可靠性。尽管如此，即使在>100Hz MS/MS的情况下，在每次分析中，某些肽可能不会被选择用于裂解，尤其是在使用短梯度时。

已开发了运行间匹配（MBR）方法来解决此缺失值问题。MBR使用窄的m/z和保留时间窗口提取所有待量化肽的强度信息。这种过滤器组合，以前认为不够具体，导致比率测量不准确。4D-MBR在第一个m/z和保留时间过滤器上增加了一个额外的CCS过滤器，允许更大的特异性，如我们的应用说明所示LC-MS 151.

DIA与PASEF的结合^®允许补偿传统的DIA陷阱：通过在连续tims事件中使用m/z隔离窗口模式，DIA PASEF中使用的离子百分比必威官网体育下载^®可以大大增加（对于低复杂度样本，可以达到100%，对于高复杂度样本，仍然比使用类似隔离窗口大小和m:z范围的传统DIA方法高5倍）。迪亚帕塞夫酒店^®可缩短循环时间，使其与短梯度分离兼容，同时保持高选择性。它得益于tims空间浓度效应，该效应允许提高灵敏度，并将DIA选择性提升到下一个水平，实现全4D蛋白质组学™ 支持

迪亚帕塞夫^®现在可以使用OpenSwath&MOBI-DIK或Biognosys的Spectronaut软件处理数据。通过阅读我们的应用说明了解更多信息LC-MS 157和LC-MS 160.