4d-proteomics™

随着TimStof平台的推出,通过使用耦合到UHR-QTOF技术的时间来增加气相离子分离的附加尺寸来实现技术的下一个演化。这导致从3D-蛋白质组学(保留时间,M / Z和MS / MS指纹)的转变为4D-Proteomics TM(添加内在CCS值)。

4D-MBR和DIA-PASEF

4D-MBR和DIA-PASEF®:迎来4D-Proteomics™领域

在TIMSTOF Pro和TIMSTOF Flex中添加离子移动性维度比灵敏度,选择性和MS / MS / MS采集速度的增加更多的益处。唯一的Tims设计允许​​可重复测量所有检测到的离子的碰撞截面(CCS)值,并且那些可用于进一步提高系统的选择性,从复杂样本和短梯度分析中实现越来越可靠的相对定量信息。

DIA-PaseF®

4D-MBR:解决缺失的值问题

4D-MBR:解决短梯度LFQ实验的缺失值问题

DIA是最广泛使用的采集策略来解决缺失的价值问题。然而,使用它需要施工光谱文库 - 当涉及罕见的生物时,可以及时且困难 - 传统的DIA方法太慢与短梯度分析相容。在这种情况下,PASEF-LFQ提供速度,灵活性和可靠性。尽管如此,即使具有> 100Hz MS / MS,可能不会选择某些肽在每个分析中进行碎片,特别是在使用短梯度的同时。

已经开发出运行(MBR)方法之间的匹配来解决此缺失的值问题。MBR提取使用窄M / Z和保留时间窗口的所有肽的强度信息。先前建议的滤波器组合不足以足够,导致比率不准确。4D-MBR将额外的CCS滤波器添加到第一个M / Z和保留时间,允许如我们的应用笔记中所示更大的特异性LC-MS 151

4D-MBR在高通铁血浆蛋白质组学结果上应用于192例患者和20 QC等离子体样品的定量,使用EVoseP一体的LC系统用11.5分钟的梯度分离。(点击放大)

DIA-PASEF.

DIA-PASEF.®:将DIA分析分析到一个下一级

Dia与pasef的组合®允许弥补传统的DIA陷阱:通过在连续的TIMS事件中使用M / Z隔离窗口的模式,DIA-PaseF中使用的离子的百分比必威官网体育下载®可以大大增加(低复杂性样本达到100%,仍比使用可比较隔离窗口尺寸和M:Z范围的传统DIA方法高5倍,高复杂性样本)。DIA-PASEF®可以减少循环时间,使其与短渐变分离相兼容,同时保持高选择性。它从Tims空间集中效果中受益,允许增加灵敏度,并通过完整的4D-Proteomics™支持将DIA选择性接受下一级别。

DIA-PASEF.®现在可以使用OpenSwath&Mobi-Dik或Biognosys的Spectronaut软件处理数据。通过阅读我们的应用笔记来了解更多信息LC-MS 157LC-MS 160