全面的蛋白质和PTMs表征带来了一些挑战,包括最大化序列覆盖、检测低丰度修饰肽以及处理糖基化或磷酸化等特定修饰所遇到的片段化挑战。
最大化序列覆盖率
从蛋白质产品生产控制到猎枪原型学实验中PTMs的定位,最大化序列覆盖是必须的。结合额外的离子迁移率分离和timsTOF Pro的高质量MS/MS光谱@ > 100 Hz,是最大化片段肽数量的关键,从而实现蛋白质序列覆盖。例如,对于抗体或生物仿制药生产控制,使用timsTOF Pro可以在非常短的10分钟梯度中获得100%的重链和高链的序列覆盖率。
在散弹蛋白质组学实验中,从蛋白质产品生产控制到PTMs的定位,最大化序列覆盖率是必须的。
最大化MS / MS信息
与共振激发CID不同,四极碰撞电池中的CID产生更有活力和更全面的碎裂模式。肽序列信息可直接从磷酸肽MS2谱中获得。timsTOF PRO还具有对给定前体获得不同碰撞能量的独特能力,在分析糖肽时产生最优的糖和肽片段。
仅供研究用途。不用于临床诊断程序。