SRX软件
用SRX软件进行定量分析
获取和本地化→
可视化→
分析
生物成像是一门定量学科
虽然图像本身可以在视觉上给人留下深刻印象，并提供定性、描述性的信息，但生物成像更侧重于定量测量。定量测量使科学家能够测试和检验假设，并进行数据驱动的实验。
定位显微镜在一段时间内生成一系列精确的分子定位数据。然后使用这些数据创建图像。定位数据允许对样品中的分子位置进行直接定量分析，与基于图像的技术(如STED和SIM)相比，提供了一种根本不同的分析类型。
SRX软件中可用的测量类型
SRX软件提供了许多工具，允许用户根据获取的定位数据的统计分析进行测量。测量包括空间分布、聚类分析、共定位、分辨率分析、活细胞分析和建模控制数据的生成。
空间分布
检查定位数据空间分布的实验是基础分析，可以作为进一步分析的先导。空间分布测量提供了有关细胞不同区域内定位密度的有价值的信息。比较不同处理或条件下细胞区域之间的定位分布差异或相同细胞区域的差异，可以为分子组成提供有用的见解，并为理解通路和分子功能提供有价值的推断。提供的分析分布的工具包括Ripley的K，对相关性和最近邻。
聚类分析
分子通常形成簇，通过空间分布分析可以很容易地识别出簇。根据其他光学显微镜的发现，如共聚焦，通常在实验前假设或假设簇的潜在存在。
分子簇存在的意义可能与它们的结构作用、功能作用或两者有关。在一定的环境下，细胞内的条件发生变化，细胞群就会形成。在不同的条件下，星系团的组成也可能发生变化。团簇的形成和组成也可能与其他团簇或分子有关(见共定位)。
聚类分析提供了对样本中观察到的聚类的更详细的分析。聚类分析对话框允许用户为聚类分析设置参数，如粒子类型、粒子大小和粒子计数，并具有显示功能，以帮助可视化聚类形成，并具有各种测量参数，以查看和输出到.csv或.mat文件。集群可视化也可以显示在SRX的主可视化窗口中，并且可以用来过滤数据。
聚类分析测量包括粒子计数、聚类面积、聚类密度、聚类大小(体积)、质心位置和主成分分析。
Co-localization
共定位是聚类分析和空间分析的自然延伸，用户可以查看不同类型分子的聚类关系，以及未形成聚类的分子的关系。
聚类分析对话框允许用户配置不同类型聚类分子的测量值。输出显示共定位测量的图形显示，表格数据，以及在SRX可视化窗口显示图像结果。协同本地化数据可以以.csv和.dat格式输出。
共定位测量包括Mander重叠系数、强度相关商、对相关、最近邻、联合直方图和Storm-RLA聚类分析。
Live-Cell分析
活细胞实验通常需要量化粒子或群集(物体)随时间的位置变化。活细胞分析跟踪粒子位移并显示它们随时间的移动。
然后可以根据这些数据生成距离、速度和角分布直方图，以辅助分析。图形显示和运动图可以输出为图像，表格数据可以输出为.csv和.mat文件。
