一道代谢组学

非靶向代谢组学是一种无需假设的方法,目的是在单一分析中捕获尽可能多的代谢物。

介绍

一切都在你的数据中……

一道代谢组学

非靶向代谢组学的目的是快速和可靠地识别小分子生物标记物,这些生物标记物具有响应内部或外部扰动的特定生理状态的特征。

利用Bruker的高性能可以最大限度地覆盖和阐明代谢组的化学空间气相,核磁共振系统结合专用软件进行数据评估。

MetabolicProfiler™是一种独特的高分辨率MS和NMR连接,能够通过MS和NMR数据的联合统计评估来快速检测和识别生物标志物。

化合物的识别

识别未知代谢物通常被定义为研究人员进行非靶向代谢组学的一个主要挑战。将准确的质谱信息和NMR的结构分辨率与专为de-novo识别定制的软件解决方案相结合,Bruker提供了解决这一挑战的独特解决方案。

核磁共振和质谱提供了补充的数据

  • 质谱提供了正确的元素组成
  • 核磁共振数据使去新生结构阐明成为可能
  • 正确的元素组成有助于并加速核磁共振中未知元素的识别
  • NMR可用于分析化合物的结构异构体,并验证LC-MS结果

质谱分析

  • SmartFormula3D:通过结合MS和MS/MS光谱中精确的质量和同位素模式信息,独特的分子公式生成能力
  • 复合式爬虫:在ChemSpider、Metlin或KEGG等数据库中查询正确的分子式
  • FragmentExplorer:提供SmartFormula 3D结果、质谱和分子结构之间的交互链接。该集成工具基于著名的化学结构chemdrawtm技术,专门为快速解释MS/MS数据而设计。
  • GC-APCI来源:GC-MS工作流程中的ID未知数
核磁共振结构说明工具:
  • 使分离混合物后的分子结构得到简单而有效的说明
  • 自动化许多分析和解释步骤
  • 使已完成的研究和初学者加快对未知物质的说明
  • AMIX包含所有必要的工具,以建立自己的谱基或使用Bruker的商业谱基

MetaboScape

一道代谢组学

MetaboScape®

MetaboScape®是一个非靶向LC-MS和MALDI成像数据的综合软件包,旨在最大限度地检测和注释更多的化合物。应用霸王龙®(时间对齐区域完全提取)算法自动提取所有相关峰,并将属于同一化合物的离子合并为一个特征,即同位素、电荷状态、加合物或碎片。保留时间比对确保了数据的一致性,即使色谱变化之间的LC-MS运行发生。结合互补信息获得的正负电离模式产生更深入的见解,更广泛的化合物类在您的样品。

自动和自信的识别化合物

捕获离子迁移光谱(TIMS)根据代谢产物的形状分离代谢产物,产生更清洁的MS/MS光谱,并允许使用CCS值来增加4D-MetabolomicsTM和4D-LipidomicsTM注释的可信度——除了保留时间、前体质量、同位素模式和MS/MS光谱。

通过使用一些工具可以方便地注释未知元素:
  • 库匹配全面填充的Bruker库,如Metlin派生的MetaboBASE®(链接到光谱页面),包含>100,000化合物在QTOF仪器测量和>250,000额外的硅化合物
  • 自动生成分子式(SmartFormula)
  • 通过公共数据库查询进行结构分配
  • 使用MetFrag进行候选结构的硅化破碎

将你的结果置于生物环境中

利用MetaboScape在代谢通路图上绘制已识别的代谢物®将实验数据与生物学联系起来。这可以导致一个被验证的研究问题,或形成一个新的假设。

统计分析

一道代谢组学

AMIX

目前,测量复杂的样品是许多代谢组学实验室的常规工作。代谢组学工作流的一个组成部分是应用统计方法来快速定位相关信息和生成知识。

AMIX充分整合NMR、HPLC和LC-MS数据的光谱和统计分析,更好地找到有效的代谢组学结果。ProfileAnalysis是LC-MS数据快速、全面多元统计分析的理想平台,OPUS是红外、近红外和拉曼光谱测量、处理和评估的领先软件。

利用谱库可以很容易地识别已知化合物

AMIX包含所有必要的工具,以建立您自己的NMR谱基或使用Bruker的商业谱基。该LibraryEditor可以建立自己的MS(MS)光谱库,并查询已经存在的。