非靶向代谢组学

非靶向代谢组学是一种无假设的方法,旨在在一次分析中捕获尽可能多的代谢物。

介绍

都在你的数据里…

非靶向代谢组学

非靶向代谢组学旨在快速可靠地识别特定生理状态下响应内部或外部扰动的小分子生物标记物。

利用Bruker的高性能,可以实现代谢组学化学空间的最大覆盖和阐明,GC-MS核磁共振与数据评估专用软件相结合的系统。

高分辨率MS和NMR的独特联用,代谢分析仪™, 通过MS和NMR数据的组合统计评估,实现快速生物标记物检测和识别。

复合鉴定

识别未知代谢物通常被定义为研究人员进行非靶向代谢组学的一个主要挑战。将准确的质谱信息和NMR的结构分辨率与专为de-novo识别定制的软件解决方案相结合,Bruker提供了解决这一挑战的独特解决方案。

核磁共振和质谱提供了补充数据

  • MS提供了正确的元素组成
  • 核磁共振数据可以从头解释结构
  • 正确的元素组成有助于并加速核磁共振中未知的鉴定
  • NMR可用于分析化合物的结构异构体并验证LC-MS结果

质谱

  • SmartFormula3D:通过结合MS和MS/MS光谱中的精确质量和同位素模式信息,生成独特的分子式
  • CompoundCrawler:在ChemSpider、Metlin或KEGG等数据库中查询正确的分子式
  • FragmentExplorer:提供SmartFormula 3D结果、质谱和分子结构之间的交互链接。该集成工具基于著名的化学结构分析技术,专为更快地解释MS/MS数据而设计。
  • GC-APCI源:基于GC-MS的工作流中的未知ID
核磁共振结构解释工具:
  • 在混合物分离后实现简单有效的分子结构说明
  • 自动执行许多分析和解释步骤
  • 使已完成的研究和初学者能够加快未知物质的澄清
  • AMIX包含所有必要的工具,以建立自己的谱基或使用Bruker的商业谱基

变形金刚

非靶向代谢组学

变形金刚®

变形金刚®是一个用于非目标LC-MS和MALDI成像数据的综合软件包,旨在最大限度地检测和注释更多化合物。应用霸王龙®(时间对齐区域完全提取)算法自动提取所有相关峰,并将属于同一化合物的离子组合成一个特征,即同位素、电荷态、加合物或碎片。保留时间校准可确保数据一致性,即使LC-MS运行之间发生色谱转移。结合正负电离模式中获得的互补信息,可以更深入地了解样本中更广泛的化合物类别。

化合物的自动可靠识别

捕获离子迁移率光谱法(TIMS)根据代谢物的形状分离代谢物,产生更清洁的MS/MS光谱,并允许使用CCS值增加4D代谢组学STM和4D脂质组学STM注释的可信度——以及保留时间、前体质量、同位素模式和MS/MS光谱。

使用多种工具方便了未知数的注释:
  • 库匹配到全面填充的Bruker库,如Metlin衍生的MetaboBASE®(链接到光谱页面),包含在QTOF仪器上测得的>100000种化合物和>250000种额外的硅化合物
  • 自动生成分子式(SmartFormula)
  • 通过公共数据库查询进行结构赋值
  • 利用MetFrag对候选结构进行硅内破碎

把你的结果放在生物学背景下

利用MetaboScape在代谢通路图上绘制已识别的代谢物®将实验数据与生物学联系起来。这可能导致一个经过验证的研究问题,或者形成一个新的假设。

统计分析

非靶向代谢组学

阿米克斯

目前,测量复杂的样品是许多代谢组学实验室的常规工作。代谢组学工作流的一个组成部分是应用统计方法来快速定位相关信息和生成知识。

AMIX充分整合NMR、HPLC和LC-MS数据的光谱和统计分析,更好地找到有效的代谢组学结果。ProfileAnalysis是LC-MS数据快速、全面多元统计分析的理想平台,OPUS是红外、近红外和拉曼光谱测量、处理和评估的领先软件。

已经知道的化合物可以很容易地用光谱库来识别

AMIX包含所有必要的工具,用于建立您自己的NMR谱库或使用Bruker的商业谱库。LibraryEditor允许您构建自己的MS(MS)光谱库并查询现有的光谱库。

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