核磁共振的软件

Amix

为了探索光谱数据,布鲁克创建了AMIX程序,它独特地结合了NMR和MS数据分析。今天学到更多。

概述

无与伦比的光谱和代谢组学的整合

布鲁克的AMIX程序提供了一系列强大的工具,使您能够最大限度地利用您的数据。AMIX为统计和光谱分析提供了许多集成的例程。广泛应用的生产力,如代谢组学,小分子研究和混合物分析得到了提高。

独特的是NMR和MS数据的综合分析。在许多应用中,如结构验证,它们在其他应用程序中彼此确认,例如代谢组合,它们也是互补的。您可以从可自定义的用户界面中受益和高度优化的性能。除了一般分析工具外,还提供了一套专门的工具包,用于不同的应用。它们可以单独运行或组合模式。AMIX为Windows,Linux和UNIX平台提供。

主要的AMIX工具包包括

  • Protein-ligand筛选
  • 小分子结构验证
  • 复杂混合物的分析剖面
  • 光谱基地
  • 代谢组学

特性

  • 可直接评估多达4个维度的多通道数据
    (nmr, lc-nmr, ms, lc-ms, ft-ms, uv)
  • 一套完整的光谱分析工具,包括光谱代数,模式识别,模式探索,高通量工具,完整的峰和多重分析,数据匹配
  • 一个数据操作和数据管理工具家族准备光谱和建立自己的光谱基础
  • 一个SQL接口,可直接在ORACLE数据库中存储和使用光谱
  • 用于相对或绝对量化的工具,包括线形状分析的峰值积分,峰值建模,最大熵方法,模式量化
  • 一种命令模式,允许在其他程序环境中执行重要功能,如桶表计算和光谱匹配,例如在TopSpin Au程序中

应用程序

蛋白质 - 配体筛选

基于受体的技术

  • 自动HSQC比对,检测光谱变化
  • PCA分析来区分变化的来源
  • 光谱间的赋值转移
  • 滴定系列中的峰示踪
  • 制表报告,例如带有峰值距离、体积和线宽的报告

基于配体的技术

  • 自动1D匹配技术
  • 种子:结合1D, STD, LOGSY和CPMG分析,有或没有竞争配体
  • 种子设置
  • 种子的自动执行
  • 结合数据查看
  • 表报告

复杂混合物的解析剖面

AMIX提供了识别和定量复杂混合物的剖面模块。光谱和分子信息在光谱库和知识库中提供。它适用于一维、二维NMR和LC-MS谱图。

  • 更安全的识别通过子光谱匹配使用光谱库与参考数据
  • 综合鉴定在1D,Cozy,Tocsy,HSQC和LC-MS中
  • 知识库中提供的详细信息包括信号的多重性和耦合性
  • 用1D或2D HSQC光谱定量
  • 可能的相对和绝对量化
  • 不同的量化技术包括正态积分、线形分析和基于最大熵的方法
  • 全交互控制的结果
  • 报告简称简称和详细版本,格式包括文本,HTML和XML
  • 结果表可以作为PCA分析的输入(有针对性的方法)

代谢组学

Amix完全集成了NMR,HPLC和LS-MS数据的光谱和统计分析,以更好地找到有效的代谢结果。

  • 不同的桶处理方法,包括外部表的导入
  • Pca, simca, pls, pls - da,预测
  • 交叉验证和测试集验证
  • 模型构建技术
  • 完整的光谱访问分数,影响和霍特林图
  • 载荷与光谱区域之间的直接联系
  • 灵活的显示设置
  • 载荷与鉴定化合物的光谱基础之间的联系
  • 由质量载荷直接求和公式计算
  • 分析变量分布,检测上下调节
  • 协方差分析
  • 结合协方差分析
  • 链接到外部属性表
  • 结合剖面结果

技术细节

光谱库和数据库

AMIX包含所有必要的工具来建立自己的光谱库或使用布鲁克的商业光谱库。光谱在以一种特殊的压缩格式存储之前被清理和分配。自动化和历史跟踪允许快速批处理。用户定义的关键字,分子信息,链接到外部数据库可以附加到光谱。可以存储在磁盘或SQL数据库(如ORACLE)中。所有主要的AMIX工具包都提供有效的数据选择。

  • 准备光谱清理工具箱
  • 自动和批量清理工具可用
  • 通过历史机制清理跟踪
  • 用户定义键的附件从频谱基础有效选择
  • 多种替代复合名称
  • 谱碱可以包含1D、2D NMR数据和分子结构
  • AMIX可以处理多种光谱基
  • 光谱基础访问在任何应用程序中都是可用的,例如链接到代谢组学中的负荷分析