核磁共振的软件

Amix

为了探索光谱数据,Bruker创建了AMIX程序,它独特地结合了核磁共振和MS数据分析。今天学到更多。

概述

无与伦比的光谱学和代谢组学的整合

Bruker的AMIX程序提供了一组功能强大的工具,使您能够最大限度地利用数据。AMIX提供了许多用于统计和光谱分析的集成例程。生产力广泛的应用,如代谢组学,小分子研究和混合分析的提高。

独特的是结合了核磁共振和质谱数据的分析。在结构验证等许多应用中,它们相互确认,而在代谢组学等其他应用中,它们也是互补的。您可以从可定制的用户界面和高度优化的性能中获益。除了通用的分析工具外,还为不同的应用程序提供了一套专门的工具包。它们可以单独运行,也可以以组合模式运行。AMIX针对Windows、Linux和Unix平台提供。

主要的AMIX工具包包括

  • Protein-ligand筛选
  • 小分子的结构验证
  • 复杂混合物的分析剖面
  • 光谱基地
  • 代谢组学

特性

  • 直接评估多达4维的多模态数据
    (nmr, lc-nmr, ms, lc-ms, ft-ms, uv)
  • 完备的光谱分析工具,包括光谱代数、模式识别、模式探索、高通量工具、全峰和多峰分析、数据匹配等
  • 一个家庭的数据操作和数据管理工具准备光谱和建立自己的光谱基础
  • 一个SQL接口选择存储和使用光谱直接在一个ORACLE数据库
  • 相对或绝对量化工具包括峰积分线形状分析,峰建模,最大熵方法,模式量化
  • 一种命令模式,允许重要的功能,如桶表计算和光谱匹配在其他程序环境中执行,例如在TopSpin Au程序中

应用程序

Protein-Ligand筛选

基于受体的技术

  • 自动HSQC比较检测光谱变化
  • 用主成分分析来区分变化的来源
  • 在光谱之间转移分配
  • 滴定系列中的峰示踪
  • 表格报告,例如峰值距离,体积和线宽

基于配体的技术

  • 自动1D匹配技术
  • 种子:加入或不加入竞争配体的1D、STD、LOGSY和CPMG联合分析
  • 设置的种子
  • 种子的自动执行
  • 结合数据查看
  • 表报告

复杂混合物的分析剖面

AMIX提供了一个用于识别和量化复杂混合物的分析模块。光谱和分子信息由光谱库和知识库提供。它适用于一维和二维核磁共振以及LC-MS谱。

  • 更安全的识别通过子光谱匹配使用光谱基与参考数据
  • 1D、COSY、TOCSY、HSQC、LC-MS联合鉴定
  • 知识库中提供的详细信息包括信号的多重性和耦合性
  • 用一维或二维HSQC谱进行定量
  • 相对和绝对量化是可能的
  • 不同的量化技术包括常规积分、线形分析、基于最大熵的方法
  • 完全交互式控制的结果
  • 报告可在简短和详细的版本,格式包括文本,html和xml
  • 结果表可以用作主成分分析的输入(有针对性的方法)

代谢组学

AMIX充分整合了NMR、HPLC和LS-MS数据的光谱和统计分析,以更好地找到有效的代谢组学结果。

  • 不同的桶装方法,包括导入外部表
  • Pca, simca, pls, pls - da,预测
  • 交叉验证和测试集验证
  • 模型构建技术
  • 全光谱访问分数,影响和霍特林的情节
  • 载荷和光谱区域之间的直接联系
  • 灵活的显示设置
  • 化合物鉴定中载荷与谱基之间的联系
  • 直接和公式计算从质量载荷
  • 分析变量分布以发现向上/向下的调节
  • 协方差分析
  • 结合协方差分析
  • 链接到外部属性表
  • 结合分析结果

技术细节

光谱库和数据库

AMIX包含所有必要的工具,以建立自己的谱基或使用Bruker的商业谱基。光谱被清理和分配之前被存储在一个特殊的压缩格式。自动化和历史跟踪允许快速批处理。用户自定义的键,分子信息,外部数据库的链接可以附加到光谱。存储可以在磁盘上,也可以在ORACLE等SQL数据库中。在所有主要的AMIX工具包中都可以有效地选择数据。

  • 准备工具包,以清理光谱
  • 可提供自动和批量清理工具
  • 通过历史机制进行清理跟踪
  • 附件用户定义的键,以有效地选择光谱基
  • 多个可选的复合名称
  • 谱基可以包含1D、2D NMR数据和分子结构
  • AMIX可以处理多个光谱基
  • 光谱基础访问可在任何应用程序,如链接到负荷分析在代谢组学