核磁共振的软件

Amix

为了探索光谱数据,Bruker创建了AMIX程序,它独特地结合了NMR和MS数据分析。今天学到更多。

概述

光谱学和代谢组学的卓越整合

布鲁克的AMIX项目提供了一系列强大的工具,使您能够最大限度地利用数据。AMIX为统计和光谱分析提供了许多集成的例程。广泛应用的生产力,如代谢组学,小分子研究和混合物分析得到提高。

独特的是核磁共振和质谱数据的结合分析。在结构验证等许多应用中,它们相互确认,而在代谢组学等其他应用中,它们也是互补的。您可以从可定制的用户界面和高度优化的性能中获益。除了通用的分析工具外,还为不同的应用提供了一套专门的工具包。它们可以单独运行,也可以组合运行。AMIX适用于Windows、Linux和Unix平台。

主要的AMIX工具包包括

  • Protein-ligand筛选
  • 小分子结构验证
  • 复杂混合物的分析剖面
  • 光谱基地
  • 代谢组学

特性

  • 直接评估多模态数据高达4维
    (nmr, lc-nmr, ms, lc-ms, ft-ms, uv)
  • 一套完整的光谱分析工具,包括光谱代数、模式识别、模式探索、高通量工具、全峰和多重谱分析、数据匹配
  • 一个家庭的数据操作和数据管理工具,准备光谱和建立自己的光谱基础
  • 一个SQL接口,可选择存储和使用光谱直接在ORACLE数据库
  • 用于相对或绝对量化的工具,包括线形分析的峰积分,峰建模,最大熵方法,模式量化
  • 一种命令模式,允许桶表计算和光谱匹配等重要功能在其他程序环境中执行,例如在TopSpin Au程序中

应用程序

Protein-Ligand筛选

基于受体的技术

  • 全自动HSQC比对检测光谱变化
  • 用主成分分析来区分变化的来源
  • 光谱之间赋值的转移
  • 滴定系列中的峰示踪
  • 表格式报告,如峰值距离、体积和线宽

基于配体的技术

  • 自动化1D匹配技术
  • 种子:结合1D、STD、LOGSY和CPMG分析,有无竞争配体
  • 设置的种子
  • 种子的自动执行
  • 结合数据查看
  • 表报告

复杂混合物的分析剖面

AMIX提供了一个识别和定量复杂混合物的剖面模块。光谱和分子信息在光谱库和知识库中提供。它适用于1D和2D NMR以及LC-MS谱。

  • 通过使用光谱基与参考数据进行亚光谱匹配更安全的识别
  • 1D、COSY、TOCSY、HSQC、LC-MS联合鉴定
  • 知识库中提供的详细信息包括信号的多重性和耦合
  • 1D或2D HSQC光谱定量
  • 可以进行相对和绝对量化
  • 不同的量化技术包括法向积分、线形分析、基于最大熵的方法
  • 结果的完全交互式控制
  • 报告可在简短和详细的版本,格式包括文本,html和xml
  • 结果表可以作为PCA分析的输入(目标方法)

代谢组学

AMIX充分整合了NMR、HPLC和LS-MS数据的波谱和统计分析,更好地找到有效的代谢组学结果。

  • 不同的桶方法,包括外部表的导入
  • Pca, simca, pls, pls - da,预测
  • 交叉验证和测试集验证
  • 模型构建技术
  • 从分数、影响和霍特林图获得完整的光谱
  • 载荷和光谱区域之间的直接联系
  • 灵活的显示设置
  • 化合物鉴定的载荷和光谱基础之间的联系
  • 直接和公式计算质量载荷
  • 分析变量分布,检测上下调节
  • 协方差分析
  • 结合协方差分析
  • 链接到外部属性表
  • 结合分析结果

技术细节

光谱库和数据库

AMIX包含所有必要的工具,以建立您自己的光谱基或使用布鲁克的商业光谱基。在以特殊的压缩格式存储之前,光谱被清理和分配。自动化和历史跟踪允许快速批处理。用户定义的键,分子信息,链接到外部数据库可以附加到光谱。存储可以存储在磁盘上,也可以存储在ORACLE等SQL数据库中。在所有主要的AMIX工具包中都可以有效地选择数据。

  • 光谱清理的准备工具
  • 自动和批量清理工具可用
  • 清理跟踪通过历史机制
  • 用户自定义键的附件,有效地选择光谱基地
  • 多个可选复合名称
  • 光谱基可以包含1D、2D NMR数据和分子结构
  • AMIX可以处理多个光谱基
  • 光谱基础访问可在任何应用程序,如链接到代谢组学的负荷分析