在生物制药的药物发现实验室中,整个工作流程都是基于目标的,所有的初始工作都集中在识别和理解与疾病相关的目标。然而,靶标的发现超出了疾病相关性的基础研究,它同样必须回答有关结构信息和与其他蛋白质相互作用的所有问题,如信号级联。布鲁克的生物物理方法组合为您提供了广泛的正交方法,以尽可能广泛地调查感兴趣的目标。所有这些信息使在随后的开发阶段更合理的建立和药物发现过程成为可能。
关键的第一步是评估靶点的临床相关性,即靶点的调节是否会产生临床所需的结果。在这个阶段很重要在活的有机体内利用转基因和疾病模型进行研究,通常使用工具化合物,以确定目标的潜力。使用布鲁克的临床前成像系统,比如BioSpec核磁共振和Skyscan CT可以提供疾病期间可能与感兴趣的特定靶点相必威官网体育下载关的精确事件。通过纵向成像评估获得动物总数的额外信息和减少在活的有机体内在一段时间内完全功能的器官/组织中的生物标志物。
疾病状态的蛋白质组特征,如上调和/或下调,可以被阐明timsTOF pro系列.高速(高达100赫兹)和由于PASEF(平行积累序列片段)方法的灵敏度提供了最深入的蛋白质组学霰弹蛋白质组学。
目标的发现不仅仅是疾病相关性的基础研究,它同样需要回答所有关于结构信息和与其他蛋白质相互作用的问题,例如信号级联。布鲁克的生物物理方法组合为您提供了广泛的正交方法,以尽可能广泛地调查感兴趣的目标。
x射线衍射是对几百kDa的高分子量物质进行结构测定的金标准方法。这项技术在最好的分辨率下可以深入了解蛋白质的结构和结合行为。由于对同步加速器的访问经常受到严重限制,布鲁克提供了D8风险提供最先进的SC xrd机器,具有内部晶体结构测定或晶体筛选的自动化能力。
溶液中的蛋白质还可以通过核磁共振进行结构研究。更小的蛋白质,甚至是高度灵活或内在无序的蛋白质也同样适用于核磁共振分析超高磁场核磁共振.此外,核磁共振可以研究蛋白质的结构和在溶液中的动态,通常是在生理条件下,以及了解配体的结合,包括亲和力。下一代高分辨率固态核磁共振技术(快马斯,DNP)最终开创了确定诸如固态膜蛋白等目标结构的道路。
交联质谱分析(XL-MS)及氢氘交换质谱(HDX-MS)提供了互补的解决方案,以解决这些问题的结构阐明的目标。XL-MS技术提供了优秀的洞察国际米兰——和分子内的相互作用和蛋白质通过识别氨基酸之间有选择性地与特定的侧链反应(通常赖氨酸和氨基酸),提供的信息部分与其他部分或与其他蛋白质相互作用的蛋白质。HDX-MS提供蛋白质的哪些部分是溶剂可接触的信息。HDX-MS也可用所谓的“足迹”实验来确定表位/拟位,或配体结合位点。
表面等离子体共振(SPR)将关键信息添加到目标发现过程(Link)。对生物分子靶点和潜在结合物(分析物)之间相互作用的无标记和实时分析提供了超越亲和关系的相互作用的见解。动力学速率常数允许理解目标分析物复合物的暂时稳定性。同时,SPR能够分析在不同pH或辅助因子等可变条件下的特定相互作用。此外,SPR可以阐明分析物与蛋白质的结合机制(例如变构结合)。通过这种方式,SPR可以更精确、实时地了解目标蛋白的生物学背景。提供正交的方法核磁共振, SPR是一种常用的技术,用于通过已建立的粘合剂或片段进行目标验证。