目标发现

正交生物物理方法的投资组合,以全面了解潜在目标及其结构

概述

在生物药物发现实验室中,整个工作流程都是基于目标的,所有最初的努力都集中在识别和理解与疾病相关的目标上。但是,目标发现超出了疾病相关性的基础研究,它同样必须回答有关结构信息以及与其他蛋白质相互作用的所有问题。信号级联。Bruker的生物物理方法组合为您提供了广泛的正交方法,以尽可能广泛地研究感兴趣的目标。所有这些信息都可以在随后的开发阶段进行更理性的基础和药物发现过程。

关键的第一步是评估目标的临床相关性,即对目标的调节是否导致临床期望的结果。在这个阶段很重要体内使用转基因和疾病模型的研究通常使用工具化合物来确定靶标的潜力。使用布鲁克的临床前成像系统,例如Biospec MRISkyscan Ct可以在疾病期间提供与特定目标有关的疾病期必威官网体育下载间的精确事件。通过纵向成像评估,获得了其他信息和减少动物总数体内一段时间内,在功能齐全的器官/组织中生物标志物。

疾病状态(例如上调和/或下调)的蛋白质组学表征可以通过timstof Pro系列。高速(高达100 Hz)和由于PASEF引起的灵敏度(Parellel积累串行片段化)方法提供了对蛋白质组学对蛋白质组的最深刻见解。

目标发现超出了疾病相关性的基础研究,它同样必须回答有关结构信息以及与其他蛋白质相互作用的所有问题。信号级联。Bruker的生物物理方法组合为您提供了广泛的正交方法,以尽可能广泛地研究感兴趣的目标。

X射线衍射是用于确定数百kDa的高分子重量的结构测定的金标准方法。该技术充其量可以对蛋白质的结构和结合行为进行深入了解。由于访问对同步元通常受到严重限制,因此布鲁克(Bruker)提供D8冒险提供最先进的SC XRD机器,具有内部晶体结构确定或晶体筛选的自动化能力。

溶液中的蛋白质可以通过NMR进行结构研究。较小的蛋白质,甚至具有高度柔韧性或本质上无序的蛋白质,同样可用于NMR分析,并具有较高的和超高场NMR。此外,NMR允许研究溶液中通常在生理条件下的蛋白质结构和动力学,并了解包括亲和力在内的配体的结合。下一代高分辨率固态NMR技术(快速MAS,,,,DNP)最终开创了结构确定靶标在其固态的靶标的路径。

交联质谱(XL-MS)和氢氘交换质谱法(HDX-MS)提供补充解决方案,以解决目标结构阐明目标的问题。XL-MS技术通过识别与某些侧链有选择性反应(通常往往赖氨酸和氨基末端)的氨基酸,对蛋白质内和蛋白质之间的分子内和分子内相互作用提供了极大的见解,提供了有关蛋白质的哪些部分与蛋白质相互作用的信息其他部分或其他蛋白质。HDX-MS提供有关蛋白质哪些部分可访问的信息。HDX-MS还可以使用所谓的“足迹”实验来确定表位/副型或配体结合位点。

表面等离子体共振(spr)将关键信息添加到目标发现过程(链接)中。对生物分子靶标与潜在粘合剂(Analyte)之间相互作用的无标签和实时分析,可深入了解超出亲和力的相互作用。动力学速率常数可以理解靶分析物复合物的时间稳定性。同时,SPR能够分析在不同条件(例如不同的pH或副因素)下的特定相互作用。另外,SPR可以阐明分析物与蛋白质的结合机制(例如变构结合)。这样,SPR允许更精确,实时地了解靶蛋白的生物学环境。提供正交的方法NMR,SPR是一种常用的技术,用于具有已建立的粘合剂或片段的目标验证。

응용

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