目标发现

正交生物物理方法组合,全面洞察潜在目标及其结构

概述

在生物制药药物发现实验室中,整个工作流程是基于目标的,所有初始工作都集中在识别和理解与疾病相关的靶点上。然而,靶点发现超出了与疾病相关的基础研究,它同样必须回答与结构信息和相互作用有关的所有问题其他蛋白质,如信号级联。Bruker的生物物理方法组合为您提供了广泛的正交方法,以尽可能广泛地研究感兴趣的目标。所有这些信息使我们能够在随后的开发阶段更合理地发现和发现药物。

关键的第一步是评估靶点的临床相关性,即靶点的调节是否会产生临床期望的结果。在这一阶段,重要的是体内使用转基因和疾病模型进行研究,通常使用工具化合物,以确定目标的潜力。使用Bruker的临床前成像系统,如BioSpec磁共振成像天空扫描CT可以提供疾病期间可能与特定目标相关的精确必威官网体育下载事件。通过对动物进行纵向影像学评估,可获得更多信息并减少动物总数体内一段时间内功能完整的器官/组织中的生物标记物。

疾病状态的蛋白质组学特征,如上调和/或下调,可以通过timsTOF Pro系列由于PASEF(平行积累序列片段化)方法的高速(高达100 Hz)和灵敏度,使我们能够通过鸟枪蛋白质组学对蛋白质组进行最深入的研究。

目标发现超越了疾病相关性的基础研究,它同样必须回答有关结构信息以及与其他蛋白质相互作用的所有问题,例如信号级联。Bruker的生物物理方法组合为您提供了广泛的正交方法,以尽可能广泛地调查感兴趣的目标。

X射线衍射是确定数百kDa高分子量结构的金标准方法。该技术以最佳分辨率深入了解蛋白质的结构和结合行为。由于同步加速器的使用通常受到严重限制,Bruker提供了D8风险投资提供最先进的SC XRD机,具有内部晶体结构测定或晶体筛选的自动化能力。

溶液中的蛋白质可以通过核磁共振进行额外的结构研究。较小的蛋白质,甚至具有高度柔性或内在无序的蛋白质,同样适用于高强度和高强度的核磁共振分析超高场核磁共振此外,NMR可以研究溶液中的蛋白质结构和动力学,通常是在生理条件下,还可以了解配体的结合,包括亲和力。下一代高分辨率固态NMR技术(快速MAS,DNP)最终开辟了固态膜蛋白等目标的结构测定途径。

交联质谱(XL-MS)和氢氘交换质谱(HDX-MS)提供补充解决方案,以解决目标结构阐明中的这些问题。XL-MS技术通过识别选择性与某些侧链(通常是赖氨酸和氨基末端)反应的氨基酸,对蛋白质内部和之间的分子间相互作用提供了极好的洞察力,提供关于蛋白质的哪些部分与其他部分或与其他蛋白质相互作用的信息。HDX-MS提供关于蛋白质的哪些部分可通过溶剂访问的信息。HDX-MS也可以使用所谓的“足迹”实验来确定表位/副表位或配体结合位点。

表面等离子体共振(SPR)将关键信息添加到目标发现过程(链接)。生物分子靶标和潜在粘合剂(分析物)之间相互作用的无标签实时分析提供了超越亲和力的相互作用洞察力。动力学速率常数允许理解目标分析物复合物的时间稳定性。同时,SPR能够分析可变条件下的特定相互作用,如不同pH值或协同因素。此外,SPR可以阐明分析物与蛋白质的结合机制(例如变构结合)。通过这种方式,SPR可以更精确、实时地了解目标蛋白质的生物学背景。提供一种正交的方法核磁共振SPR是一种常用的技术,用于利用已建立的粘合剂或片段进行目标验证。

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