Lipidomics

脂质组学是研究生物系统中细胞脂质的途径和网络。脂质组学研究给定细胞或有机体中一整套脂质(脂质组)的结构和功能,以及它们与其他细胞成分的相互作用。

脂质图谱和鉴定

脂质图谱和鉴定

Lipidomics

脂质组定义为细胞、组织或有机体内的完整脂质谱,即所有脂质的子集。许多代谢疾病都涉及到脂质作为复杂细胞过程的调节因子,这证实了脂质组学研究日益增加的兴趣。主要目的是发现具有疾病特征的生物标记物,或作为内部或外部扰动的标记物。

在脂质组学研究中,确定脂质是至关重要的。由于大量的结构变化,这种对脂质的诠释可能是苛刻的。利用Bruker的timsTOF fleX技术,脂质可以广泛地进行表征,使用LC-PASEF给出分子式和链组成,并使用SpatialOMx与组织的空间分布联系起来®工作流。

4d -脂质组学™工作流程通过提供独特的优势来解决这些挑战:

  • LC-PASEF数据的采集timsTOF职业timsTOF fleX
  • PASEF的高采集速度导致在单次运行中>多10倍的MS/MS
  • 使用MOMA(迁移率偏移质量对齐)清除等压干扰的质谱/质谱
  • 数据处理和标注MetaboScape®SCiLS™或同时使用ESI和MALDI成像数据
  • 基于规则的脂质注释常规可以根据脂质组学标准倡议指南对脂质物种进行鉴定
  • ccpredict对注释进行验证,通过基于结构预测CCS值,进一步提高了注释的置信度
  • 直观的4D可视化研究脂质分配工具使用CCS和保留时间感知Kendrick质量缺陷(KMD)图
  • LipidBlast1支持,最大的脂质组学库,包括> 55万个含有CCS值的脂质结构
Tsugawa H., et al. 2020,自然生物技术,https://doi.org/10.1038/s41587-020-0531-2
脂类(LC)标注工具避免了过度标注的风险,并通过使用选择的碎片规则简化了脂类特征的自动识别。

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