脂质组学

脂质组学是研究生物系统中细胞脂质的途径和网络。脂质组学研究的是给定细胞或生物体内整套脂质(脂质体)的结构和功能,以及它们与其他细胞成分的相互作用。

脂质的分析和鉴定

脂质的分析和鉴定

脂质组学

脂质体定义为细胞、组织或生物体内的完整脂质体,即所有脂质的子集。许多代谢性疾病涉及脂质作为复杂细胞过程的调节因子,这证实了人们对脂质组学研究的兴趣与日俱增。其主要目的是发现疾病特征的生物标记物,或作为内部或外部扰动的标记物。

在脂质组学研究中,脂质的可靠鉴定至关重要。由于存在大量的结构变异,对脂质的这种注释可能要求很高。利用Bruker的timsTOF-fleX技术,可以广泛地描述脂质的特征,使用LC-PASEF给出分子式和链组成,并与空间分布相关联使用SpatialOMx对组织进行n测试®工作流程。

4D脂质组学™ 工作流通过提供独特的好处,在一个完整的解决方案中解决了这些难题:

  • 在计算机上采集LC-PASEF数据蒂姆斯托夫职业酒店蒂姆斯托夫曲
  • PASEF的高采集速度导致单次运行的毫秒/毫秒数增加10倍以上
  • 使用MOMA(迁移率偏移质量对齐)去除等压干扰的更清洁的MS/MS光谱
  • 计算机中的数据处理与标注变形金刚®SCiLS™或ESI和MALDI成像数据
  • 基于规则的脂质注释程序能够根据脂质组学标准倡议指南识别脂质种类
  • 通过CCSProdict验证注释,通过基于结构预测CCS值,进一步提高注释的可信度
  • 使用CCS和保留时间感知的Kendrick质量缺陷(KMD)图对脂质分配工具进行直观的4D可视化研究
  • 成脂细胞1.支持,最大的脂质组学库,包括超过550000个含有CCS值的脂质结构
[1] Tsugawa H.等人,2020年,自然生物技术,https://doi.org/10.1038/s41587-020-0531-2
脂质类(LC)注释工具避免了过度注释的风险,并通过使用选定的碎片规则简化了脂质特征的自动识别。
MetaboScape 2021脂质类注释

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