代谢组学方法

霸王龙®LC-QTOF解决方案

因为每一步都很重要……

简化霸王龙®LC-QTOF代谢组学方法

有几个关键步骤对于确定与动态代谢过程相关的化合物非常重要;包括样品制备、数据采集和数据评价。只有控制了所有这些工作流步骤,才能在生物环境中获得有意义的见解。为了简化和协调这些,布鲁克与加拿大阿尔伯塔大学的李亮教授和他的团队合作,开发了T-ReX®LC-QTOF解决方案。

“霸王龙……®LC-QTOF解决方案“包括一切,为研究人员在非靶向代谢组学方面提供领先优势

关键的第一步一道代谢组学是一种可重复制备的样品。因此,标准操作程序(sop)准备典型的临床研究样本,包括尿液和血浆,提供作为代谢组学解决方案的一部分。

在非靶向代谢组学工作流程中,使用T-ReX进行样品制备,获得高质量的LC-MS/MS数据®LC-QTOF溶液,无需LC-MS/MS参数优化。分析大样本队列,需要高保留时间稳定性洗提UHPLC与专用的霸王龙相结合®洗脱液代谢组试剂盒:提供RP。该反相LC色谱柱试剂盒能够匹配保留时间的值布鲁克HMDB代谢物库2.0.的影响二世MS/MS数据采集使用优化的参数,其强大的性能是高质量数据采集的基础,使复杂样品的广泛分析研究。

接下来的数据采集,MetaboScape®软件提供了精简的数据评估,能够自动和有信心地识别相关的已知化合物:

  • 独特的霸王龙®三维特征提取技术是后续代谢物鉴定和统计数据评价的关键。通过自动进行参数自由保留时间比对和区域完全提取,提取所有相关信息,使代谢物鉴定更加可信,同时降低了统计分析中的假阴性率。
  • 布鲁克HMDB代谢物库2.0作为代谢组学解决方案的一部分,提供>800代谢物的MS/MS光谱,以及>600相关代谢物的保留时间信息。库是确定相关标记的先决条件。
  • 注释质量(AQ)评分提供了一个快速的概览,使每个注释参数都有信心。
  • 路径映射功能可以将已识别的化合物设置到生物环境中。

“我们很高兴与布鲁克合作,制作了全面的霸王龙®LC-QTOF解决方案.完整的开箱即用的解决方案为相关已知内源性代谢物的高可信度鉴定提供了基础,并能够使用路径图将其设置到生物学环境中。这种解决方案将为研究人员在尿液或血浆等典型研究样本的非靶向代谢组学研究提供一个先机。”

梁丽博士,加拿大艾伯塔大学化学教授

mrm aXelerate

磁共振质谱(MRMS)分型

通过UHPLC-QTOF-MS/MS分析,可以对复杂混合物进行深入的代谢谱分析,以便在表型分析的背景下发现代谢组学。通常,不同的LC方法和正负离子模式下的数据采集相结合,这是有成本的;分析每个样品所需的时间。
磁共振质谱(MRMS)极端分辨率通过省去耗时的色谱法,可以加速物候组学和发现代谢组学研究中的样品吞吐量。流动注射分析(FIA)或基于MALDI的工作流程提供了对LC-MS分析不易检测到的化合物的访问,并同时分析已知和未知代谢物。
对于高通量需求,通常遇到在表型学研究,UHPLC-QTOF-MS/MS分析由MRMS aXelerate补充,一个无lc的MRMS工作流解决方案,检测和生成每个样品> 1000中-高水平代谢物的分子式,并揭示许多在LC-MS中未见的额外代谢物,包括极性化合物。通过FIA或MALDI的MRMS分析为复杂样品(如尿液和血浆提取物)的表型分析提供了高的样品吞吐量。T-ReX强大的数据提取®二维的MetaboScape®为自动注释提供信心。这是通过质量精度<0.2 ppm和质量分辨率可以超过>1百万,从而提高同位素精细结构保真度实现的。

在最近的出版物中了解FIA-CASI-MRMS工作流程如何通过与人类代谢组数据库的匹配增加2.6倍和IFS模式的增加,帮助解决阐明“暗代谢物质”的问题:发现代谢组学中精确质量分析的增强同位素精细结构方法:FIA-CASI-FTMS

“MRMS极端分辨率使我们能够解决下一代代谢分型问题,即同时快速描述数百种已知和数千种与动态生物/化学过程相关的新代谢产物。MRMS与MetaboScape的结合还将使其他研究人员能够了解这一新的令人兴奋的研究领域探索尚未“黑暗”的代谢组。”

Philippe Schmitt Kopplin教授,分析生物地球化学,德国赫尔姆霍兹-岑特鲁姆慕尼黑

Mas给

仅供研究用途。不用于临床诊断程序。