代谢组学溶液

T-ReX®LC-QTOF溶液

因为每一步都很重要…

简化的霸王龙®LC-QTF代谢组学溶液

几个关键步骤对于自信地识别与动态代谢过程相关的化合物非常重要;包括样品制备、数据采集和数据评估。只有在控制所有这些工作流步骤的情况下,才能在生物环境中获得有意义的见解。为了简化和协调这些,布鲁克与梁丽教授和他的团队在加拿大艾伯塔大学合作开发了T-ReX。®液相色谱-定量分析法。

…霸王龙®LC-QTOF解决方案”包括为研究人员提供非靶向代谢组学方面的一切

关键的第一步非靶向代谢组学是一种可重复的样品制备方法。因此,作为代谢组学溶液的一部分,提供了制备典型临床研究样本(包括尿液和血浆)的标准操作程序(SOP)。

高质量LC-MS/MS数据的采集遵循T-ReX在非靶向代谢组学工作流程中的样品制备®LC-QTOF溶液,无需LC-MS/MS参数优化。要分析需要高保留时间稳定性的大样本队列洗脱超高可编程逻辑控制器与专用的T-ReX结合使用®洗脱代谢组学试剂盒:提供RP。反相液相色谱柱套件可使保留时间与色谱柱中的值相匹配Bruker HMDB代谢物库2.0. 这个影响二对于MS/MS数据采集,使用优化的参数,其稳健的性能是高质量数据采集的基础,能够对复杂样本进行广泛的分析研究。

在数据采集之后变形金刚®软件提供了简化的数据评估,实现了相关已知化合物的自动和可靠识别:

  • 独特的霸王龙®三维特征提取技术是后续代谢产物识别和统计数据评价的关键。通过自动进行无参数保留时间比对和区域完全提取,提取所有相关信息以实现可靠的代谢物识别,同时降低统计分析中的假阴性率。
  • 这个Bruker HMDB代谢物库2.0作为该代谢组学解决方案的一部分,该解决方案为>800种代谢物提供MS/MS光谱,并为>600种相关代谢物提供保留时间信息。该库是可靠识别相关标记的先决条件。
  • 注释质量(AQ)评分提供了一个快速的概览,使每个注释参数有信心。
  • 通路定位功能可以将已识别的化合物置于生物环境中。

“我们很高兴能与Bruker合作,制作出全面的霸王龙®LC-QTOF溶液. 完整的开箱即用解决方案为相关已知内源性代谢产物的高置信度鉴定提供了基础,并能够使用路径映射将其设置为生物学背景。该解决方案将为研究人员在尿液或血浆等典型研究样本的非靶向代谢组学方面提供领先优势。”

李亮博士,加拿大阿尔伯塔大学化学系教授

阿克塞拉特

磁共振质谱(MRMS)分型

通过UHPLC-QTOF-MS/MS分析,可以对复杂混合物进行深度代谢谱分析,用于发现表型背景下的代谢组学。典型的不同的LC方法和数据采集在正负离子模式相结合,这是一个成本;每个样品分析所需的时间。
磁共振质谱(MRMS)极端分辨率可以通过省去耗时的色谱,加速表型组学和发现代谢组学研究中的样品吞吐量。流动注射分析(FIA)或基于MALDI的工作流程可以获得LC-MS不易检测到的化合物,同时分析已知和未知的代谢物。
对于高通量需求,如表型组学研究中通常遇到的,UHPC-QTOF-MS/MS分析由MRMS aXelerate补充,MRMS aXelerate是一种无LC的MRMS工作流解决方案,可检测并生成每个样品中超过1000种中高水平代谢物的分子式,并揭示LC-MS中未发现的许多额外代谢物,包括极性化合物。FIA或MALDI的MRMS分析为复杂样本(如尿液和血浆提取物)的表型分析提供了高样本吞吐量。T-ReX强大的数据提取功能®二维输入变形金刚®提供自动注释的信心。这是通过<0.2 ppm的质量精度和可超过100万的质量分辨率实现的,从而提高了同位素精细结构保真度。

在最近的出版物中了解FIA-CASI-MRMS工作流如何通过与人类代谢组数据库匹配和IFS模式增加2.6倍来帮助解决阐明“暗代谢物质”的探索:发现代谢组学中精确质量分析的增强同位素精细结构方法:FIA-CASI-FTMS

MRMS的超高分辨率使我们能够解决下一代代谢分型问题,即与动态生物/化学过程相关的数百种已知和数千种新代谢产物的同时快速描述。MRMS与MetaboScape的结合也将使其他研究人员能够阐明这一新的和令人兴奋的研究领域,探索尚未“黑暗的代谢组”。

Philippe Schmitt-Kopplin教授,分析生物地球化学,Helmholtz中心München,德国

马吉奥里信息

仅供研究使用。不用于临床诊断程序。