代谢组学方法

有几个关键步骤对于确定与动态代谢过程相关的化合物非常重要;包括样品制备、数据采集和数据评价。只有控制了所有这些工作流步骤，才能在生物环境中获得有意义的见解。为了简化和协调这些问题，Bruker与加拿大阿尔伯塔大学的Liang Li教授及其团队合作，开发了T-ReX®LC-QTOF解决方案。

关键的第一步一道代谢组学是一种可重复制备的样品。因此，标准操作程序(sop)准备典型的临床研究样本，包括尿液和血浆，提供作为代谢组学解决方案的一部分。

采用T-ReX®LC-QTOF溶液，无需进行LC-MS/MS参数优化，在非靶向代谢组学工作流程中进行样品制备，即可获得高质量的LC-MS/MS数据。分析大样本队列，需要高保留时间稳定性洗提UHPLC结合专用T-ReX®洗脱代谢组学试剂盒:提供RP。该反相LC色谱柱试剂盒能够匹配保留时间的值布鲁克HMDB代谢物库2.0．的影响二世MS/MS数据采集使用优化的参数，其强大的性能是高质量数据采集的基础，使复杂样品的广泛分析研究。

接下来的数据采集，MetaboScape®软件提供了精简的数据评估，能够自动和有信心地识别相关的已知化合物:

• 独特的T-ReX®3D特征提取技术是后续代谢物鉴定和统计数据评估的关键。通过自动进行参数自由保留时间比对和区域完全提取，提取所有相关信息，使代谢物鉴定更加可信，同时降低了统计分析中的假阴性率。

• 的布鲁克HMDB代谢物库2.0作为代谢组学解决方案的一部分，提供>800代谢物的MS/MS光谱，以及>600相关代谢物的保留时间信息。库是确定相关标记的先决条件。

• in - silica在Bruker中生成了MS/MS谱MetaboBASE®个人图书馆3.0能够初步确定尚未作为纯参考标准提供的相关目标。

• 注释质量(AQ)评分提供了对每个注释参数的信心的快速概述。

• 路径映射功能使确定的化合物进入生物环境。

磁共振质谱(MRMS)的表型分析

通过UHPLC-QTOF-MS/MS分析，在表型背景下发现代谢组学的复杂混合物的深入代谢分析成为可能。通常将不同的LC方法和正负离子模式的数据采集相结合，这是有成本的;每个样品分析所需的时间。
磁共振质谱(MRMS)极端分辨率可以通过省去耗时的色谱，加速表型组学和发现代谢组学研究中的样品吞吐量。流动注射分析(FIA)或基于MALDI的工作流程提供了不易通过LC-MS分析检测的化合物，并同时分析已知和未知的代谢物。
对于高通量需求，通常遇到在表型学研究，UHPLC-QTOF-MS/MS分析由MRMS aXelerate补充，一个无lc的MRMS工作流解决方案，检测和生成每个样品> 1000中-高水平代谢物的分子式，并揭示许多在LC-MS中未见的额外代谢物，包括极性化合物。通过FIA或MALDI的MRMS分析为复杂样品(如尿液和血浆提取物)的表型分析提供了高的样品吞吐量。强大的数据提取T-ReX®2D在MetaboScape®为自动注释提供信心。这是通过质量精度<0.2 ppm和质量分辨率可以超过>1百万，从而提高同位素精细结构保真度实现的。

在最近的出版物中了解FIA-CASI-MRMS工作流是如何帮助解决与人类代谢组数据库匹配和IFS模式增加2.6倍的“黑暗代谢物质”的需求的:发现代谢组学中精确质量分析的增强同位素精细结构方法:FIA-CASI-FTMS