几个关键步骤对于自信地识别与动态代谢过程相关的化合物是重要的;包括样品准备,数据采集和数据评估。只有在控制所有这些工作流程步骤中,才能获得生物上下文中的有意义的见解。为了简化和协调这些,布鲁克与加拿大艾伯塔大学梁丽和他的团队合作开发了T-Rex®LC-QTOF解决方案。
第一个关键步骤非靶向代谢组学是一种可重复的样品制备。因此,提供用于制备典型的临床研究样本(包括尿液和血浆)的标准操作程序(SOP),作为该代谢组科溶液的一部分。
采集高质量的LC-MS / MS数据,遵循非目标代谢物工作流程的样品制备,具有T-rex®LC-QTOF解决方案,不需要LC-MS / MS参数优化。分析需要高保留时间稳定性的大型样本队列洗脱uhplc.与专用的T-rex结合使用®洗脱代谢型/套件:RP提供。反向相LC列套件使得保留时间与值匹配Bruker HMDB代谢物库2.0。这影响II对于MS / MS数据采集,使用优化的参数,其强大的性能是高质量数据采集的基础,从而实现复杂样品的大量分析研究。
遵循数据采集后,Metaboscape.®软件提供简化的数据评估,使相关的已知化合物的自动和自动识别:
“我们很高兴与Bruker合作,以生产全面T-REX.®LC-QTOF解决方案。盒子解决方案的完整提供了相关已知的内源代谢物的高置信度识别的基础,并且可以使用途径测绘将这些设置为生物学背景。该解决方案将为研究人员提供典型的研究样品,如尿液或血浆等典型研究样本。“
磁共振质谱(MRMS)的表型分析
通过UHPLC-QTOF-MS/MS分析,在表型背景下发现代谢组学的复杂混合物的深入代谢分析成为可能。通常将不同的LC方法和正负离子模式的数据采集相结合,这是有成本的;每个样品分析所需的时间。
磁共振质谱(MRMS)极端分辨率可以通过省去耗时的色谱,加速表型组学和发现代谢组学研究中的样品吞吐量。流动注射分析(FIA)或基于MALDI的工作流程提供了不易通过LC-MS分析检测的化合物,并同时分析已知和未知的代谢物。
对于高通量需求,通常遇到的表达研究中,UHPLC-QTOF-MS / MS分析由MRMS Axelerate互补,其无直接的MRMS工作流溶液,其检测和产生每个样品的1,000中高水平代谢物的分子公式并揭示了LC-MS中未见的许多额外的代谢物,包括极性化合物。FIA或MALDI的MRMS分析为复杂样品的表型(例如尿液和血浆提取物)提供了高样本的产量。T-Rex强大的数据提取®2DMetaboscape.®为自动注释提供信心。这是通过浓缩的质量精度和质量分辨率的质量精度来实现,该质量分辨率可能超过> 100万,从而提高同位素细结构保真度。
在最近的出版物中了解FIA-CASI-MRMS工作流是如何帮助解决与人类代谢组数据库匹配和IFS模式增加2.6倍的“黑暗代谢物质”的需求的:发现代谢组学中精确质量分析的增强同位素精细结构方法:FIA-CASI-FTMS
“MRMS极端分辨率使我们能够解决下一代代谢类型,即同时快速描述与动态生物/化学过程相关的数百种已知和数千种新代谢物。MRMS与MetaboScape的结合也将使其他研究人员能够阐明这一新的、令人兴奋的研究领域,探索尚未‘黑暗代谢组’。”
仅供研究使用。不适用于临床诊断程序。