布鲁克代谢组学光谱库

包含相关内源性和外源代谢物的质谱文库使您能够与实验性MS/MS光谱匹配自动删除。这些光谱库中包含的化合物数量是一个重要因素，并且在近年来一直在不断增长，从而鉴定出越来越多的已知代谢产物。

例如，这反映了新版本的Bruker Metabobase^®个人图书馆3.0。它包含：

• 除内源性和外源性代谢物外，还衍生出源自众所周知的Metlin（*）化合物库的MS/MS光谱，包括众所周知的Metlin（*）化合物库，包括二肽和三肽，用于研究生物系统中发生的变化。这些数据已在QTOF仪器上获取。Bruker QTOF Instruments已获得了14,000多个数据。
  
• 塞里科生成的MS/MS光谱超过233,000种化合物在此库中，为更快的暂定识别尚未作为纯参考标准提供的相关目标铺平了道路。
  

Bruker Metabobase^®个人图书馆3.0由著名的Gary Siuzdak教授和Paul Benton博士提供。

*Metlin™是Scripps研究所的商标。

注意：布鲁克metabobase^®个人图书馆3.0仅由代谢^®4.0更高。

重要的不仅是光谱的数量，尽管库中包含的数据的质量也对自信识别非常重要。
所有光谱都包含在Bruker HMDB代谢物图书馆2.0是手动检查去除嘈杂的光谱和污染物峰。校正前体和片段离子的质量以匹配理论质量值和同位素模式分布。

该光谱库的第二个版本比6000 ms/ms光谱超过800种化合物从人类代谢组数据库（HMDB）以及保留时间信息中选择。Bruker HMDB代谢物库2.0的数据是使用纯参考标准获得的。所有化合物均在使用5种不同的碰撞能级的高分辨率高分辨率质谱仪上测量。

保留时间信息对于相反的相位LC，大约600个代谢产物增加了进一步的正交信息，以增加对识别例如尿液，血液和其他生物流体中的代谢产物的信心。

这T-Rex洗脱代谢组学：RP是一个敬业的人r越来越pHase LC列套件，用于将匹配的保留时间匹配到Bruker HMDB代谢物库2.0中的相应值。它还包含用于LC-MS/MS数据采集的方法和标准操作程序（SOP），并且是完整的一部分

T-Rex LC-QTOF简化非靶向代谢组学的解决方案。

Bruker HMDB代谢物图书馆由Bruker专门提供，并与Liang Li和David Wishart教授及其团队合作生产。

光谱是使用商业标准和在型号豆科植物Medicago truncatula中发现的推定的代谢物创建的。这可以鉴定植物和食品研究中的代谢产物。布鲁克·萨姆纳元代表酶^®工厂库还包含228个光谱，用于由MS和NMR鉴定的84种化合物。

最近在Bruker Timstof仪器上获取的150多个化合物的碰撞横截面（CCS）值的最新添加可以匹配来自被困的离子移动性分离的正交信息。除了前体质量和同位素模式，保留时间和MS/MS光谱外，还允许基于CCS值鉴定化合物。光谱库包含在多个碰撞能量中获取的光谱，并以ESI负值模式获得。对于大多数化合物分子式，提供 *.mol格式，Inchi和笑容的结构。

这Bruker Nist 2020质谱库是由布鲁克（Bruker）重新分配的国家标准技术研究所（NIST）的产物。该库包含完整的NIST包装，并覆盖了Marbofloxacin抗生素，萘E＆L，APCI，Luteolin葡萄糖剂黄酮，视黄酸代谢物，FUC-GM1（D18：1/16：0）糖脂等的化合物。它被细分为几个光谱库：

• NIST/EPA/NIH质谱库：此版本包含350,704个电子电离（EI）光谱（306,643种化合物，43,774重复光谱） - 比NIST17的增加39,729种化合物的增加39,729种化合物
• 气相色谱保留指数和方法库：这包含139,382种化合物的447,289个保留指数（RI）值，增加了40K化合物。还包括RI和MS的114,629种化合物
• 小分子的NIST串联质谱库：其中包含来自30,999个化合物的185,608个前体离子的1,320,389个光谱

代谢组由覆盖宽动态范围的小分子的复杂混合物组成。随着可检测物质的数量继续增加，包括哺乳动物，微生物和植物性内源性和外源代谢产物，因此鉴定对于充分了解代谢组数据的生物学环境至关重要。

因此，先前描述的已知靶代谢产物的注释称为剥削，变得至关重要，必须是自动和结论性的。
只有在置信度很高的情况下，才能在生物环境中获得有意义的见解。通过匹配存储在包含相关内源和外源代谢物的数据库和光谱文库中的不同标准来获得这种置信。

可以从Bruker上获得的高质量LC-MS/MS数据得出的信息QTOF仪器并与光谱库匹配以确定自信的识别，包括准确的前体质量和同位素模式，MS/MS光谱和保留时间信息以及CCS值。代谢^®根据用户定义的阈值级别启用匹配此信息。图形注释质量“ aq”表示使分析师能够轻松评估其对分类中自动生成的每个注释的信心^®。

在完全集成的代谢中支持了几个互补的光谱库^®用于自动化和阳性鉴定已知化合物的工作流解决方案。这些代谢物库包括Bruker HMDB代谢物库，Bruker Metabobase^®个人图书馆，布鲁克·纳内态^®植物图书馆，Bruker NIST光谱库以及更多公众以及定制图书馆。

这些光谱库存储在您的PC上，提供本地搜索功能，以提供性能以及整个过程并消除隐私问题。

为了识别代谢物，需要收集所有可用的信息。这包括将碎片光谱从纯标准品到从代谢组样品获得的光谱进行比较。特定的片段质量和强度分布有价值地有助于代谢物鉴定。

使用光谱库内容使用代谢^®软件要么布鲁克数据分析（除非没有另行说明）。两者都在本地PC上运行并提供私人搜索功能。此外，两种软件解决方案都设计为创建自定义库专有化合物，并将其导出到ASCII格式。这允许共享图书馆具有开源格式的同事。

Bruker Library编辑器很容易建立自己的MS/MS光谱库。扩展现有化合物光谱的覆盖范围或通过例如从例如不同的碰撞能量。在多个碰撞能量下测量的库光谱可确保自动且高度高的置信度鉴定多种代谢物。