布鲁克代谢组学光谱库

包含相关内源性和外源性代谢物的质谱库使您能够与实验MS/MS光谱进行匹配，从而实现自动复制。这些光谱库中包含的化合物的数量是一个重要的因素，近年来不断增长，使得越来越多的已知代谢物得以鉴定。

这在新版的力量MetaboBASE^®私人图书馆3.0。它包含:

• 来自著名的METLIN(*)化合物库的超过100,000个合成或分离的标准品，包括二肽和三肽，以及内源性和外源性代谢物，用于研究生物系统中发生的变化。这些数据是通过QTOF仪器获得的。布鲁克QTOF仪器已收集了14,000多份数据。
  
• in - silica生成的MS/MS谱图超过233000种化合物在这个图书馆中，为更快地初步确定尚未作为纯参考标准提供的有关指标铺平了道路。
  

的力量MetaboBASE^®个人图书馆3.0由Gary Siuzdak教授和Paul Benton博士提供。

*METLIN™是斯克里普斯研究所的商标。

注:布鲁克代谢酶^®个人库3.0仅支持MetaboScape^®4．0甚至更高。

不仅光谱的数量很重要，图书馆中包含的数据质量也很重要，这对有信心的鉴定非常重要。
所有光谱都包含在布鲁克HMDB代谢物库2.0是手动检查去噪光谱和污染峰。对前体离子和碎片离子的质量进行了校正，以符合理论质量值和同位素模式分布。

这个光谱库的第二个版本提供的不仅仅是6000 MS / MS多光谱800种化合物从人类代谢组数据库(HMDB)和保留时间信息中选择。Bruker HMDB代谢物库2.0的数据采用纯参考标准。所有化合物都在QTOF高分辨率质谱仪上用5种不同的碰撞能级进行了测量。

保留时间信息对于大约600个代谢物的反相LC增加了进一步的正交信息，以增加在如尿液、血液和其他生物体液中发现的代谢物鉴定的信心。

的T-ReX洗脱代谢组试剂盒:RP是一个专用R埃弗斯-P相色谱柱试剂盒，用于匹配布鲁克HMDB代谢物库2.0中相应值的保留时间。它还包括LC-MS/MS数据采集的方法和标准操作程序(sop)，是完整的一部分

霸王龙LC-QTOF简化非靶向代谢组学的解决方案。

Bruker HMDB代谢物库由Bruker独家提供，由加拿大阿尔伯塔大学Liang Li教授和David Wishart教授及其团队合作生成。

利用商业标准和在模型豆科植物截形苜蓿中发现的公认的代谢物建立光谱。这使得在植物和食品研究中鉴定代谢物成为可能。布鲁克-萨姆纳代谢酶^®植物库经质谱和核磁共振鉴定，含有84个化合物的228个光谱。

最近在Bruker timsTOF仪器上获得的150多种化合物的碰撞截面(CCS)值，使从捕获离子迁移率分离得到的正交信息能够匹配。除了前驱体质量和同位素模式、保留时间和MS/MS光谱外，还可以根据CCS值识别化合物。谱库包含了在多个碰撞能量下获得的光谱和ESI负离子模式下获得的光谱。对于大多数化合物，分子式、结构*。提供了mol格式、InChI和SMILES。

的布鲁克NIST 2020质谱库是国家标准与技术研究所(NIST)的产品，由布鲁克重新分配。该文库包含完整的NIST包，包括来自马博沙星抗生素，萘E&L, APCI，木质素葡萄糖苷黄酮，维甲酸代谢物，Fuc-GM1(d18:1/16:0)糖脂等化合物。它被细分为几个光谱库:

• NIST/EPA/NIH质谱库:此次发布包含350,704个电子电离(EI)谱(306,643个化合物，43,774个重复谱)——比NIST17多39,729个化合物
• 气相色谱保留指数和方法库:包含139382种化合物的447,289种保留指数(RI)值，增加了40K种化合物。此外，还包括114,629个同时具有RI和MS的化合物
• NIST小分子串联质谱库:它包含来自30999种化合物的185608个前体离子的1320,389个光谱

代谢组由复杂的小分子混合物组成，涵盖了广泛的动态范围。随着可检测物质的数量持续增长，包括哺乳动物、微生物和植物基础的内源性和外源性代谢物，鉴定对于充分理解代谢组学数据的生物学背景至关重要。

因此，对先前描述的已知目标代谢物的注释，即所谓的复制，变得至关重要，必须是自动的和结论性的。
只有当化合物被高度可靠地鉴定时，才能在生物学背景下获得有意义的见解。这种置信度是通过匹配存储在数据库和包含相关内源性和外源性代谢物的光谱库中的不同标准获得的。

从您的Bruker上获得的高质量LC-MS/MS数据可以获得的信息QTOF仪器并与光谱库匹配，以确定准确的前体质量和同位素模式，MS/MS光谱和保留时间信息，以及CCS值。MetaboScape^®启用根据用户可定义的阈值级别匹配此信息。图形化的注释质量“AQ”表示使分析师能够轻松地评估他们对MetaboScape中自动生成的每个注释的信心^®．

完全集成的MetaboScape支持几个互补的光谱库^®工作流解决方案的自动化和正面识别的已知化合物。这些代谢物库包括Bruker HMDB代谢物库、Bruker MetaboBASE^®个人图书馆，布鲁克代谢酶^®植物图书馆，布鲁克NIST光谱图书馆，以及进一步的公共和定制图书馆。

这些光谱库存储在您的PC上，提供本地搜索能力，以提供性能和整个和消除隐私的担忧。

为了鉴定代谢物，需要收集所有可用的信息。这包括从纯标准品中获得的片段光谱与从代谢组学样品中获得的光谱的比较。具体的碎片质量和强度分布有助于代谢产物鉴定。

谱库内容通过MetaboScape^®软件或力量DataAnalysis(除非另有说明)。两者都能在本地pc上运行，并提供私人搜索功能。此外，这两种软件解决方案都旨在创建自定义库并将其导出为ASCII格式。这允许共享库以开放源码的格式与同事进行交流。

建立自己的MS/MS谱库很容易与布鲁克图书馆编辑器。扩展现有化合物光谱的覆盖范围，或用进一步的参考测量，例如变化的碰撞能量，补充现有的信息。在多个碰撞能量下测量的库光谱确保了对广泛代谢物的自动和高可信度的识别。