Bruker Metabolomics光谱库

含有相关内源性和外源代谢物的质谱文库使您可以匹配实验MS / MS光谱以进行自动含量。这些光谱文库中含有的化合物的数量是近年来连续生长的重要因素，使得能够鉴定越来越多的已知代谢物。

This is reflected for example by the new version of the布鲁克MetaboBASE^®个人图书馆3.0。它包含了：

• 除了内源和外源代谢物之外，衍生自众所周知的梅林（*）复合文库的超过100,000种合成或分离标准的MS / MS光谱，包括二源性和外源代谢物，以研究生物系统中发生的变化。这些数据已在QTOF仪器上获取。已经在Bruker QTOF仪器上获得了来自14,000多个的数据。
  
• 在-In-silico生成的MS / MS光谱以上233,000种化合物在这个库中，铺平了迄今尚未作为纯粹参考标准的相关目标的速度识别。
  

Bruker Metabobase.^®个人图书馆3.0由众所周知的Gary Siuzdak和Paul Benton博士提供。

* Metlin™是Scripps Research Institute的商标。

注意：Bruker Metabobase^®个人图书馆3.0仅支持MetaboScape^®4.0更高。

这不仅是光谱的数量问题,though also the quality of the data contained in the libraries, which is highly important for confident identification.
All spectra contained in the布鲁克HMDB Metabolite Library 2.0是手动检查去除嘈杂的光谱和污染峰。校正了前体和片段离子以匹配理论质量值和同位素图案分布。

该光谱库的第二个版本提供了更多6000 MS/MS光谱超过800 compoundsselected from the Human Metabolome Data Base (HMDB) plus Retention time information. Data for the Bruker HMDB Metabolite Library 2.0 was acquired using pure reference standards. All compounds were measured on an impact series QTOF high-resolution mass spectrometer using 5 different collision energy levels.

保留时间信息对于逆向相LC，约600个代谢物增加了进一步正交的信息，以增加在鉴定尿液，血液和其他生物流体中发现的代谢产物的置信度。

这T-REX洗脱代谢Metabolomics-kit：RPis a dedicatedR.eversed-P.HASE LC列套件，用于使匹配的保留时间与Bruker HMDB代谢物库2.0中的相应值匹配。它还包含用于LC-MS / MS数据采集的方法和标准操作程序（SOP），并且是完整的一部分

T-REX LC-QTOFsolution for simplified non-targeted metabolomics.

Bruker HMDB代谢物图书馆专门由Bruker提供，并与梁立教授和大卫Whitlard教授和他们的团队合作，加拿大艾伯塔大学。

光谱是使用商业标准创建的，并在模型豆科植物，Medicago Truncatula中发现了鉴定鉴定的代谢物。这使得能够鉴定植物和食物研究中的代谢物。Bruker Sumner Metabobase^®植物图书馆还包含由MS和NMR鉴定的84种化合物的228个光谱。

在BRUKER TIMSTOF仪器上获得的最近添加的碰撞截面（CCS）值超过150种化合物，使得衍生自捕获离子迁移率分离的正交信息匹配。这允许除了前体质量和同位素图案，保留时间和MS / MS光谱之外，还允许基于CCS值鉴定化合物。光谱文库包含在多碰撞能量下获取的光谱，并在ESI负离子模式下获取。对于大多数化合物，提供了分子式的分子式，含有* .mol格式，英寸和微笑的结构。

这Bruker Nist 2020质谱库是国家标准和技术研究所（NIST）的产品，由Bruker重新分配。该文库含有完整的NIST包，涵盖来自马巴氟沙星抗生素，萘E＆L，APCI，葡萄黄素葡糖苷黄酮，视黄酸代谢物，FUC-GM1（D18：1/16：0）糖脂等的含量。它被细分为几个频谱库：

• NIST / EPA / NIH质谱库：该释放含有350,704电子电离（EI）光谱（306,643化合物，43,774重复光谱） - 比NIST17增加39,729个化合物
• 气相色谱保留指标和方法文库：这包含447,289个保留指数（RI）值为139,382化合物，增加40K化合物。还包括114,629个具有RI和MS的化合物
• 小分子的NIST串联质谱库：这含有来自30,999种化合物的185,608个前体离子的1,320,389个光谱

代谢物由覆盖宽动态范围的小分子的复杂混合物组成。随着可检测物质的数量持续增长以包括哺乳动物，微生物和基于植物的内源性和外源代谢物，鉴定对于完全理解代原数据的生物学背景是必不可少的。

因此，先前描述的已知的目标代谢物的注释称为无统计，变得至关重要，并且必须是自动和定制的。
如果化合物以高信心鉴定化合物，只能获得生物学背景下的有意义的见解。通过匹配储存在数据库中的不同标准和含有相关内源和外源代谢物的光谱文库来获得这种置信度。

可以从Bruker上获取的高质量LC-MS / MS数据派生的信息QTOF仪器与自信识别的光谱库相匹配，包括精确的前体质量和同位素图案，MS / MS光谱和保留时间信息，以及CCS值。MetaboScape^®启用根据用户可定义的阈值级别匹配此信息。图形注释质量“AQ”表示使分析师能够容易地评估它们对Metaboscape中自动生成的每个注释的信心^®。

完全集成的元标记支持了几个互补频谱库^®workflow solution for automated and positive identification of known compounds. These metabolite libraries include Bruker HMDB Metabolite Library, Bruker MetaboBASE^®个人图书馆，Bruker Metabobase^®植物库，Bruker Nist Spectral Library，以及进一步的公共和自定义图书馆。

这se spectral libraries are stored on your PC, providing local search capabilities to provide both performance and throughout and to eliminate privacy concerns.

为了识别代谢物，需要收集所有可用的信息。这包括从纯标准物中的片段光谱比较从代谢组种样品获得光谱。特定的片段质量和强度分布有助于代谢物鉴定。

使用频谱库内容使用该频谱库内容MetaboScape^®软件orBruker Dataanalysis.（除非另有说明）。两者都在本地PC上运行并提供私人搜索功能。此外，两个软件解决方案都设计为创建自定义库of proprietary compounds, and to export them to an ASCII format. This allows分享图书馆与开源格式的同事。

Building own MS/MS spectral libraries is easily possible with the Bruker library editor. Extend the coverage of existing compound spectra or complement existing information with further reference measurements from e.g. varying collision energies. Library spectra measured at multiple collision energies ensure the automatic and high confidence identification of a wide range of metabolites.