代谢^®

代谢^®uses a unified workflow to process non-targeted analyses from Bruker's ESI & MALDI Imaging instruments, simplifying the number of steps and rapidly pinpointing and identifying biomarkers.

代谢^®可以跨应用领域使用，包括发现代谢组学，脂肪组学，现象学，食品组织，环境和制药，并为用户提供灵活性，以支持从基本ID到高级统计的工作流程。

• 代谢^®功能强大的T-Rex算法包括保留时间对齐，除外和提取，以确保可靠的数据处理
• Target compounds can be automatically annotated using user defined Analyte Lists
• Unknown ID pipeline including library matching and在计算机中fragmentation to facilitate unknown ID
• 使用受监督和无监督的统计数据（包括PCA，t检验，ANOVA，PLS和存储键相关性分析）可视化相关信息集中的相关信息
• 注释质量（AQ）得分提供了五个数据质量指标
• Pathway mapping to set identified metabolites in a biological context, thereby turning data into knowledge
• 使用局部代谢产物预测来鉴定药物和异种代谢物
• Batch correction to offset sample effects in large sample cohorts
• Time series plots to investigate changes in metabolites over time
• Dedicated lipidomics annotation tools, including rule based annotation, 4D Kendrick mass defect plot and CCSPredict
• 为了简化已知的识别，代表镜^®支持Metabobase个人库，HMDB代谢物库，Bruker Sumner Metabobase植物库（包括> 130种化合物的CCS值）以及自定义库
• 定制数据导出到适合导入的文件格式GNP（全球天然产品社会分子网络）
• 客户端服务器体系结构以启用快速数据处理和多个用户共享方法和访问共享数据集
• 半目标工作流程中的半镜工作流程^®与有针对性的工作流并驾齐驱，以绝对量化使用Tasq^®

非目标分析的目的是确定特定生理状态或样本的特征的特征。由于没有单个工作流程来启用所有化合物的动态时间和空间指纹，因此有必要从互补平台中评估数据。代谢^®addresses these needs by allowing for the evaluation of complementary data from both ESI and MALDI Imaging, as well as confidently assigning relevant markers in their biological context.

通过集成工具（例如基于精确的前体和片段质量（smartformula3d），搜索本地和公共数据库（CompoundCrawler），诸如分子公式确定（CompundCrawler），识别未知化合物的识别，例如分子公式确定。在计算机中fragmentation to match theoretical to measured MS/MS (MetFrag) and MS/MS bucket matching for the identification of chemically related compounds.

未知ID管道：
A）SmartFormula3D通过自动匹配准确的质量和同位素模式片段和前体信息，将可能的前体分子式可能限制为通常一个或几个候选者。
B) Query of candidate formula in local and public databases returns possible structure candidates.
C）在计算机中使用实现的MetFrag功能的碎片将理论碎片结构与测量的MS/MS峰和得分最有可能结构相匹配。
D)可选MS/MS Bucket matching enables to assign compounds with similar MS/MS spectra for identification of further possibly unknown but likely structurally similar compounds.

药物代谢产物的鉴定不仅引起了药物研究的极大兴趣，而且对代谢组学，现象学，外博学和非目标筛查工作流的兴趣越来越大。在这里，预计将发生药物或其他异种生物的代谢物，例如农药，有毒物质或麻醉品，这可能属于未鉴定的，所谓的黑暗代谢组化合物。

代谢^®支持本地生物转化器¹-based metabolite prediction for assignment of these metabolism products both from liquid samples and directly from tissue using the SpatialOMx workflow. Additionally, changes in time of these metabolites can be tracked and semi-quantified by using integrated time series plots.

^{（[1] Djoumbou-Feunang等人； ChemInformatics Journal 2019，11：2）。}

基于规则的注释例程^®考虑到脂质物种标准倡议（LSI）指南，可以鉴定脂质物种。该脂质类（LC）注释工具避免了过度注释的风险，并简化了脂质特征的自动识别。

代谢^®can calculate and visualize Kendrick Mass Defects, turning复杂的质谱信息into a组成图with参议员的积分聚类based on lipid specific同源重复单元（例如CH₂）。可自定义的4D Kendrick质量缺陷图允许直观的脂质ID验证。提取特征的各种特征可以在4个维度（X轴，Y轴，色标和气泡尺寸）中绘制，从而允许使用多功能应用。

• Plotting保留时间与M/z揭示不同的脂质类的分离使用不同的颜色for不同的脂质类。使用此颜色编码，您可以轻松地发现保留时间明显偏差的注释或相对于同一脂质类的其余部分。
• PlottingM/z vs CCS，您可以通过可视化链长度和双键差异差异的脂质观察到的脂质趋势来进一步询问脂质数据。这些趋势可用于确认脂质类ID，并且可以协助在里面未知数的注释并提供帮助删除误报。
  
• Visualize the Kendrick Mass Defect with CH₂指定为重复单元，可以快速研究所选类别的饱和度和链长度一致性的脂质物种。此外，所示的脂质的示例被注释为三酰基甘油（TGS），揭示了使用反向相色谱法的预期洗脱顺序，以及CCS价值的增加趋势，从而充分利用了所有4个互补维度。
  

代谢组学和脂肪组学分析的主要要求是快速查明并确定因扰动或疾病而变化的化合物。匹配保留时间，前体质量，同位素模式和MS/MS光谱是获得复合注释置信度的常见标准。Pasef^®关于timstof proprovides hundreds of MS/MS events per second, resulting in a greater depth of fragment coverage in single analysis. Additionally, PASEF^®spectra benefit from ion mobility separation, therefore cleaner MS/MS spectra are obtained using an on-the-fly mobility filter. Each MS value is complemented with a collisional cross section (CCS) value to give a measure of the shape of the analyte, providing further confidence to ID.

和这个结合SCILS™实验室software, T-ReX² empowers the SpatialOMx-based non-targeted profiling for processing and annotation of features, including drug metabolites, lipids and glycans. For the first time, map analytes spatially using this unique combination of T-ReX³ and combine it with CCS-aware annotation of compounds to enable a higher confidence annotation of compounds acquired using MALDI Imaging on timsTOF fleX systems.

无色谱MRMS aXelerate workflow通过省略现象学研究中的耗时色谱法，提供了更高的样品吞吐量。可以通过LC-MS分析易于检测的化合物，从而允许靶向和非靶向代谢组学方法。T-Rex 2D在Metaboscape®中提取的数据为FIA MRMS数据的自动注释提供了信心。新型的Scimax MRMS系统可以显示出> 100万的质量分辨率，质量精度<0.2 ppm。超高的分辨能力使您能够使用同位素精细结构来实现元素组成的明确测定。这增加了非靶向代谢组学中复合ID的另一层置信度。